Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EGFRP00533 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EGFRP00533 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EGFRP00533 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EGFRP00533 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EGFRP00533 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EGFRP00533 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EGFRP00533 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EGFRP00533 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EGFRP00533 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EGFRP00533 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EGFRP00533 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EGFRP00533 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EGFRP00533 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EGFRP00533 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EGFRP00533 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EGFRP00533 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EGFRP00533 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EGFRP00533 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EGFRP00533 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EGFRP00533 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EGFRP00533 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EGFRP00533 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
EGFRP00533 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EGFRP00533 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EGFRP00533 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EGFRP00533 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EGFRP00533 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EGFRP00533 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EGFRP00533 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EGFRP00533 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EGFRP00533 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EGFRP00533 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EGFRP00533 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EGFRP00533 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EGFRP00533 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EGFRP00533 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EGFRP00533 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EGFRP00533 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EGFRP00533 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EGFRP00533 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EGFRP00533 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EGFRP00533 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EGFRP00533 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EGFRP00533 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EGFRP00533 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EGFRP00533 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EGFRP00533 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EGFRP00533 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EGFRP00533 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EGFRP00533 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EGFRP00533 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EGFRP00533 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EGFRP00533 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EGFRP00533 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EGFRP00533 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EGFRP00533 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EGFRP00533 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EGFRP00533 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EGFRP00533 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EGFRP00533 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EGFRP00533 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EGFRP00533 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EGFRP00533 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EGFRP00533 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EGFRP00533 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EGFRP00533 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EGFRP00533 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EGFRP00533 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EGFRP00533 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EGFRP00533 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EGFRP00533 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EGFRP00533 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EGFRP00533 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EGFRP00533 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EGFRP00533 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EGFRP00533 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EGFRP00533 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EGFRP00533 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EGFRP00533 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EGFRP00533 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EGFRP00533 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EGFRP00533 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EGFRP00533 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EGFRP00533 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EGFRP00533 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EGFRP00533 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EGFRP00533 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EGFRP00533 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EGFRP00533 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EGFRP00533 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EGFRP00533 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EGFRP00533 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EGFRP00533 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EGFRP00533 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EGFRP00533 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EGFRP00533 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EGFRP00533 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EGFRP00533 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EGFRP00533 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms