Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG7O95352 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG7O95352 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG7O95352 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG7O95352 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG7O95352 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG7O95352 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG7O95352 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG7O95352 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG7O95352 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG7O95352 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG7O95352 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG7O95352 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG7O95352 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG7O95352 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG7O95352 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG7O95352 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG7O95352 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG7O95352 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG7O95352 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG7O95352 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG7O95352 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG7O95352 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG7O95352 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG7O95352 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG7O95352 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG7O95352 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG7O95352 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG7O95352 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG7O95352 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG7O95352 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG7O95352 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG7O95352 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG7O95352 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG7O95352 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG7O95352 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG7O95352 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG7O95352 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG7O95352 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG7O95352 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG7O95352 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG7O95352 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG7O95352 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG7O95352 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG7O95352 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG7O95352 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG7O95352 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG7O95352 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG7O95352 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG7O95352 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG7O95352 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG7O95352 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG7O95352 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG7O95352 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG7O95352 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG7O95352 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG7O95352 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG7O95352 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG7O95352 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG7O95352 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG7O95352 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG7O95352 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG7O95352 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG7O95352 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG7O95352 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG7O95352 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG7O95352 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG7O95352 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG7O95352 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG7O95352 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG7O95352 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG7O95352 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG7O95352 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG7O95352 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG7O95352 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG7O95352 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG7O95352 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG7O95352 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG7O95352 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG7O95352 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG7O95352 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG7O95352 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG7O95352 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG7O95352 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG7O95352 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG7O95352 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG7O95352 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG7O95352 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG7O95352 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG7O95352 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG7O95352 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG7O95352 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG7O95352 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG7O95352 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG7O95352 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG7O95352 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG7O95352 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG7O95352 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG7O95352 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG7O95352 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms