Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSVO60911 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSVO60911 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSVO60911 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSVO60911 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSVO60911 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSVO60911 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSVO60911 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSVO60911 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSVO60911 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSVO60911 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSVO60911 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSVO60911 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTSVO60911 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSVO60911 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSVO60911 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSVO60911 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSVO60911 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSVO60911 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSVO60911 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSVO60911 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSVO60911 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSVO60911 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSVO60911 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSVO60911 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSVO60911 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSVO60911 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSVO60911 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSVO60911 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSVO60911 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSVO60911 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSVO60911 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSVO60911 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSVO60911 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSVO60911 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSVO60911 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSVO60911 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSVO60911 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSVO60911 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSVO60911 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CTSVO60911 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CTSVO60911 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CTSVO60911 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CTSVO60911 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CTSVO60911 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSVO60911 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSVO60911 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSVO60911 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSVO60911 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSVO60911 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSVO60911 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSVO60911 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSVO60911 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSVO60911 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSVO60911 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSVO60911 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSVO60911 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSVO60911 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSVO60911 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSVO60911 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSVO60911 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSVO60911 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSVO60911 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSVO60911 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSVO60911 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSVO60911 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSVO60911 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSVO60911 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSVO60911 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSVO60911 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSVO60911 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSVO60911 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSVO60911 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSVO60911 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSVO60911 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSVO60911 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSVO60911 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSVO60911 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSVO60911 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSVO60911 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTSVO60911 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSVO60911 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSVO60911 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSVO60911 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSVO60911 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSVO60911 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSVO60911 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSVO60911 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSVO60911 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSVO60911 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSVO60911 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSVO60911 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSVO60911 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSVO60911 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSVO60911 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSVO60911 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSVO60911 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSVO60911 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSVO60911 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTSVO60911 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms