Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPLO60437 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPLO60437 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPLO60437 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPLO60437 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPLO60437 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPLO60437 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPLO60437 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPLO60437 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPLO60437 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPLO60437 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPLO60437 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPLO60437 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPLO60437 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPLO60437 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPLO60437 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPLO60437 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPLO60437 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PPLO60437 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPLO60437 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPLO60437 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPLO60437 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPLO60437 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPLO60437 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPLO60437 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPLO60437 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPLO60437 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPLO60437 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPLO60437 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPLO60437 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPLO60437 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPLO60437 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPLO60437 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PPLO60437 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPLO60437 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPLO60437 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPLO60437 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPLO60437 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPLO60437 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPLO60437 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPLO60437 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPLO60437 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPLO60437 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPLO60437 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPLO60437 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPLO60437 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPLO60437 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPLO60437 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPLO60437 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPLO60437 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPLO60437 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPLO60437 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPLO60437 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPLO60437 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPLO60437 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPLO60437 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPLO60437 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPLO60437 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPLO60437 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPLO60437 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPLO60437 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPLO60437 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPLO60437 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPLO60437 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPLO60437 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPLO60437 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPLO60437 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPLO60437 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPLO60437 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
PPLO60437 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PPLO60437 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PPLO60437 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PPLO60437 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PPLO60437 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PPLO60437 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PPLO60437 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPLO60437 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPLO60437 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPLO60437 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPLO60437 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPLO60437 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPLO60437 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPLO60437 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPLO60437 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPLO60437 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPLO60437 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPLO60437 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPLO60437 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PPLO60437 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPLO60437 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPLO60437 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPLO60437 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPLO60437 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPLO60437 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPLO60437 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PPLO60437 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPLO60437 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPLO60437 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPLO60437 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPLO60437 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms