Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EFNA2O43921 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms