Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD28O15084 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD28O15084 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms