Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC27A2O14975 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC27A2O14975 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms