Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F3O00716 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F3O00716 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F3O00716 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F3O00716 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F3O00716 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F3O00716 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F3O00716 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F3O00716 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F3O00716 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F3O00716 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F3O00716 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F3O00716 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F3O00716 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F3O00716 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
E2F3O00716 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
E2F3O00716 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
E2F3O00716 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F3O00716 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F3O00716 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F3O00716 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F3O00716 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F3O00716 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F3O00716 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F3O00716 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F3O00716 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F3O00716 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F3O00716 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F3O00716 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F3O00716 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F3O00716 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F3O00716 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F3O00716 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F3O00716 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F3O00716 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F3O00716 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F3O00716 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F3O00716 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F3O00716 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F3O00716 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F3O00716 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F3O00716 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F3O00716 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F3O00716 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F3O00716 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F3O00716 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F3O00716 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F3O00716 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F3O00716 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F3O00716 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F3O00716 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F3O00716 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F3O00716 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F3O00716 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F3O00716 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F3O00716 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F3O00716 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F3O00716 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F3O00716 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F3O00716 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F3O00716 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F3O00716 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F3O00716 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F3O00716 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F3O00716 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F3O00716 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F3O00716 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F3O00716 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F3O00716 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F3O00716 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F3O00716 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F3O00716 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F3O00716 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F3O00716 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F3O00716 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F3O00716 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F3O00716 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F3O00716 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F3O00716 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F3O00716 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F3O00716 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F3O00716 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F3O00716 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F3O00716 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F3O00716 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F3O00716 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F3O00716 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F3O00716 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F3O00716 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F3O00716 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F3O00716 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F3O00716 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F3O00716 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F3O00716 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F3O00716 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F3O00716 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F3O00716 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F3O00716 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F3O00716 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F3O00716 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms