Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVH48-1M5A8F1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVH48-1M5A8F1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms