Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms