Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM5B3KS81 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms