Protein–RNA interactions for Protein: A8MUK1

USP17L5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L5A8MUK1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP17L5A8MUK1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms