Protein–RNA interactions for Protein: A6NKG5

RTL1, Retrotransposon-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL1A6NKG5 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RTL1A6NKG5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTL1A6NKG5 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms