Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC69A6NI79 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms