Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU8

PGPEP1L, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1LA6NFU8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PGPEP1LA6NFU8 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms