Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
VWA3AA6NCI4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VWA3AA6NCI4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms