Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRAMEF22A3QJZ6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEF22A3QJZ6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms