Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WT01

TRAV27, T-cell receptor alpha variable 27 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV27A0A087WT01 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAV27A0A087WT01 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAV27A0A087WT01 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAV27A0A087WT01 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAV27A0A087WT01 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAV27A0A087WT01 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms