Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6M7

SLC4A7, Sodium bicarbonate cotransporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A7Q9Y6M7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC4A7Q9Y6M7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC4A7Q9Y6M7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC4A7Q9Y6M7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC4A7Q9Y6M7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC4A7Q9Y6M7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC4A7Q9Y6M7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC4A7Q9Y6M7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC4A7Q9Y6M7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC4A7Q9Y6M7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC4A7Q9Y6M7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SLC4A7Q9Y6M7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC4A7Q9Y6M7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC4A7Q9Y6M7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC4A7Q9Y6M7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC4A7Q9Y6M7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC4A7Q9Y6M7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC4A7Q9Y6M7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC4A7Q9Y6M7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC4A7Q9Y6M7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC4A7Q9Y6M7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC4A7Q9Y6M7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC4A7Q9Y6M7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC4A7Q9Y6M7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC4A7Q9Y6M7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC4A7Q9Y6M7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC4A7Q9Y6M7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC4A7Q9Y6M7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC4A7Q9Y6M7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC4A7Q9Y6M7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC4A7Q9Y6M7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC4A7Q9Y6M7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC4A7Q9Y6M7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC4A7Q9Y6M7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC4A7Q9Y6M7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC4A7Q9Y6M7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC4A7Q9Y6M7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC4A7Q9Y6M7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC4A7Q9Y6M7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC4A7Q9Y6M7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC4A7Q9Y6M7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC4A7Q9Y6M7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC4A7Q9Y6M7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC4A7Q9Y6M7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC4A7Q9Y6M7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC4A7Q9Y6M7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC4A7Q9Y6M7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC4A7Q9Y6M7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC4A7Q9Y6M7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC4A7Q9Y6M7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC4A7Q9Y6M7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC4A7Q9Y6M7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC4A7Q9Y6M7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC4A7Q9Y6M7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC4A7Q9Y6M7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC4A7Q9Y6M7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC4A7Q9Y6M7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC4A7Q9Y6M7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC4A7Q9Y6M7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC4A7Q9Y6M7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC4A7Q9Y6M7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC4A7Q9Y6M7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC4A7Q9Y6M7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC4A7Q9Y6M7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC4A7Q9Y6M7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC4A7Q9Y6M7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC4A7Q9Y6M7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC4A7Q9Y6M7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC4A7Q9Y6M7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC4A7Q9Y6M7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC4A7Q9Y6M7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC4A7Q9Y6M7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC4A7Q9Y6M7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC4A7Q9Y6M7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC4A7Q9Y6M7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC4A7Q9Y6M7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC4A7Q9Y6M7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SLC4A7Q9Y6M7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC4A7Q9Y6M7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC4A7Q9Y6M7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC4A7Q9Y6M7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC4A7Q9Y6M7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC4A7Q9Y6M7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC4A7Q9Y6M7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC4A7Q9Y6M7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC4A7Q9Y6M7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC4A7Q9Y6M7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC4A7Q9Y6M7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC4A7Q9Y6M7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC4A7Q9Y6M7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC4A7Q9Y6M7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC4A7Q9Y6M7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC4A7Q9Y6M7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC4A7Q9Y6M7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC4A7Q9Y6M7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC4A7Q9Y6M7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC4A7Q9Y6M7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC4A7Q9Y6M7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC4A7Q9Y6M7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC4A7Q9Y6M7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms