Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y5

PEX16, Peroxisomal membrane protein PEX16, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX16Q9Y5Y5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX16Q9Y5Y5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX16Q9Y5Y5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX16Q9Y5Y5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX16Q9Y5Y5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX16Q9Y5Y5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX16Q9Y5Y5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX16Q9Y5Y5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX16Q9Y5Y5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX16Q9Y5Y5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX16Q9Y5Y5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX16Q9Y5Y5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX16Q9Y5Y5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX16Q9Y5Y5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX16Q9Y5Y5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX16Q9Y5Y5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX16Q9Y5Y5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX16Q9Y5Y5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX16Q9Y5Y5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX16Q9Y5Y5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX16Q9Y5Y5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX16Q9Y5Y5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX16Q9Y5Y5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PEX16Q9Y5Y5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX16Q9Y5Y5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX16Q9Y5Y5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PEX16Q9Y5Y5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
PEX16Q9Y5Y5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PEX16Q9Y5Y5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PEX16Q9Y5Y5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX16Q9Y5Y5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX16Q9Y5Y5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX16Q9Y5Y5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX16Q9Y5Y5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX16Q9Y5Y5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PEX16Q9Y5Y5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX16Q9Y5Y5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX16Q9Y5Y5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PEX16Q9Y5Y5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX16Q9Y5Y5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX16Q9Y5Y5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX16Q9Y5Y5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PEX16Q9Y5Y5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX16Q9Y5Y5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PEX16Q9Y5Y5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX16Q9Y5Y5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX16Q9Y5Y5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX16Q9Y5Y5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX16Q9Y5Y5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX16Q9Y5Y5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX16Q9Y5Y5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX16Q9Y5Y5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX16Q9Y5Y5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PEX16Q9Y5Y5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PEX16Q9Y5Y5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX16Q9Y5Y5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX16Q9Y5Y5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX16Q9Y5Y5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX16Q9Y5Y5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PEX16Q9Y5Y5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX16Q9Y5Y5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX16Q9Y5Y5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX16Q9Y5Y5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PEX16Q9Y5Y5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX16Q9Y5Y5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX16Q9Y5Y5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX16Q9Y5Y5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX16Q9Y5Y5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PEX16Q9Y5Y5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX16Q9Y5Y5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX16Q9Y5Y5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PEX16Q9Y5Y5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX16Q9Y5Y5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX16Q9Y5Y5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX16Q9Y5Y5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX16Q9Y5Y5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX16Q9Y5Y5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX16Q9Y5Y5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PEX16Q9Y5Y5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX16Q9Y5Y5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX16Q9Y5Y5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PEX16Q9Y5Y5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PEX16Q9Y5Y5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PEX16Q9Y5Y5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PEX16Q9Y5Y5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PEX16Q9Y5Y5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PEX16Q9Y5Y5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX16Q9Y5Y5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PEX16Q9Y5Y5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX16Q9Y5Y5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX16Q9Y5Y5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX16Q9Y5Y5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX16Q9Y5Y5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX16Q9Y5Y5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PEX16Q9Y5Y5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PEX16Q9Y5Y5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX16Q9Y5Y5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX16Q9Y5Y5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX16Q9Y5Y5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PEX16Q9Y5Y5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms