Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CD2APQ9Y5K6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CD2APQ9Y5K6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
CD2APQ9Y5K6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CD2APQ9Y5K6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CD2APQ9Y5K6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CD2APQ9Y5K6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CD2APQ9Y5K6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CD2APQ9Y5K6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CD2APQ9Y5K6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CD2APQ9Y5K6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CD2APQ9Y5K6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CD2APQ9Y5K6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CD2APQ9Y5K6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CD2APQ9Y5K6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CD2APQ9Y5K6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CD2APQ9Y5K6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CD2APQ9Y5K6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CD2APQ9Y5K6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
CD2APQ9Y5K6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CD2APQ9Y5K6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CD2APQ9Y5K6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CD2APQ9Y5K6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CD2APQ9Y5K6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CD2APQ9Y5K6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CD2APQ9Y5K6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CD2APQ9Y5K6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
CD2APQ9Y5K6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CD2APQ9Y5K6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CD2APQ9Y5K6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
CD2APQ9Y5K6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
CD2APQ9Y5K6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CD2APQ9Y5K6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CD2APQ9Y5K6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CD2APQ9Y5K6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CD2APQ9Y5K6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
CD2APQ9Y5K6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CD2APQ9Y5K6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CD2APQ9Y5K6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
CD2APQ9Y5K6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CD2APQ9Y5K6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CD2APQ9Y5K6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CD2APQ9Y5K6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CD2APQ9Y5K6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CD2APQ9Y5K6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CD2APQ9Y5K6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CD2APQ9Y5K6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CD2APQ9Y5K6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CD2APQ9Y5K6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
CD2APQ9Y5K6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CD2APQ9Y5K6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CD2APQ9Y5K6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
CD2APQ9Y5K6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CD2APQ9Y5K6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CD2APQ9Y5K6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CD2APQ9Y5K6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CD2APQ9Y5K6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CD2APQ9Y5K6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CD2APQ9Y5K6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CD2APQ9Y5K6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
CD2APQ9Y5K6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CD2APQ9Y5K6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CD2APQ9Y5K6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CD2APQ9Y5K6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
CD2APQ9Y5K6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CD2APQ9Y5K6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CD2APQ9Y5K6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CD2APQ9Y5K6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CD2APQ9Y5K6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
CD2APQ9Y5K6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CD2APQ9Y5K6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CD2APQ9Y5K6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CD2APQ9Y5K6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CD2APQ9Y5K6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CD2APQ9Y5K6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CD2APQ9Y5K6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CD2APQ9Y5K6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
CD2APQ9Y5K6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CD2APQ9Y5K6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CD2APQ9Y5K6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CD2APQ9Y5K6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CD2APQ9Y5K6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
CD2APQ9Y5K6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CD2APQ9Y5K6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CD2APQ9Y5K6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CD2APQ9Y5K6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CD2APQ9Y5K6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CD2APQ9Y5K6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
CD2APQ9Y5K6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CD2APQ9Y5K6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
CD2APQ9Y5K6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
CD2APQ9Y5K6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CD2APQ9Y5K6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CD2APQ9Y5K6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CD2APQ9Y5K6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
CD2APQ9Y5K6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CD2APQ9Y5K6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CD2APQ9Y5K6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
CD2APQ9Y5K6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CD2APQ9Y5K6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms