Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GIT1Q9Y2X7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GIT1Q9Y2X7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GIT1Q9Y2X7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GIT1Q9Y2X7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GIT1Q9Y2X7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GIT1Q9Y2X7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GIT1Q9Y2X7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GIT1Q9Y2X7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GIT1Q9Y2X7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GIT1Q9Y2X7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GIT1Q9Y2X7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GIT1Q9Y2X7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GIT1Q9Y2X7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GIT1Q9Y2X7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GIT1Q9Y2X7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GIT1Q9Y2X7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GIT1Q9Y2X7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GIT1Q9Y2X7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GIT1Q9Y2X7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GIT1Q9Y2X7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
GIT1Q9Y2X7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GIT1Q9Y2X7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GIT1Q9Y2X7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GIT1Q9Y2X7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.56■■■□□ 2
GIT1Q9Y2X7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GIT1Q9Y2X7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GIT1Q9Y2X7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GIT1Q9Y2X7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GIT1Q9Y2X7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GIT1Q9Y2X7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GIT1Q9Y2X7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GIT1Q9Y2X7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GIT1Q9Y2X7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GIT1Q9Y2X7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GIT1Q9Y2X7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GIT1Q9Y2X7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GIT1Q9Y2X7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.52■■■□□ 2
GIT1Q9Y2X7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
GIT1Q9Y2X7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
GIT1Q9Y2X7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GIT1Q9Y2X7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GIT1Q9Y2X7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GIT1Q9Y2X7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GIT1Q9Y2X7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GIT1Q9Y2X7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GIT1Q9Y2X7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GIT1Q9Y2X7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GIT1Q9Y2X7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GIT1Q9Y2X7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
GIT1Q9Y2X7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GIT1Q9Y2X7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GIT1Q9Y2X7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GIT1Q9Y2X7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GIT1Q9Y2X7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GIT1Q9Y2X7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GIT1Q9Y2X7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GIT1Q9Y2X7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GIT1Q9Y2X7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GIT1Q9Y2X7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GIT1Q9Y2X7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GIT1Q9Y2X7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GIT1Q9Y2X7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GIT1Q9Y2X7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GIT1Q9Y2X7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GIT1Q9Y2X7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GIT1Q9Y2X7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GIT1Q9Y2X7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GIT1Q9Y2X7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GIT1Q9Y2X7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GIT1Q9Y2X7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GIT1Q9Y2X7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GIT1Q9Y2X7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GIT1Q9Y2X7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GIT1Q9Y2X7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
GIT1Q9Y2X7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GIT1Q9Y2X7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GIT1Q9Y2X7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GIT1Q9Y2X7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GIT1Q9Y2X7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GIT1Q9Y2X7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
GIT1Q9Y2X7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GIT1Q9Y2X7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GIT1Q9Y2X7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GIT1Q9Y2X7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GIT1Q9Y2X7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GIT1Q9Y2X7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GIT1Q9Y2X7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GIT1Q9Y2X7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GIT1Q9Y2X7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GIT1Q9Y2X7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GIT1Q9Y2X7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GIT1Q9Y2X7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GIT1Q9Y2X7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GIT1Q9Y2X7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GIT1Q9Y2X7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
GIT1Q9Y2X7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GIT1Q9Y2X7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
GIT1Q9Y2X7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GIT1Q9Y2X7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms