Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2R2

PTPN22, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 22, humanhuman

Predictions only

Length 807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN22Q9Y2R2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTPN22Q9Y2R2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTPN22Q9Y2R2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPN22Q9Y2R2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPN22Q9Y2R2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPN22Q9Y2R2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTPN22Q9Y2R2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPN22Q9Y2R2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPN22Q9Y2R2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPN22Q9Y2R2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTPN22Q9Y2R2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPN22Q9Y2R2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTPN22Q9Y2R2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPN22Q9Y2R2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPN22Q9Y2R2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPN22Q9Y2R2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPN22Q9Y2R2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTPN22Q9Y2R2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPN22Q9Y2R2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPN22Q9Y2R2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPN22Q9Y2R2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPN22Q9Y2R2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTPN22Q9Y2R2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPN22Q9Y2R2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTPN22Q9Y2R2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
PTPN22Q9Y2R2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPN22Q9Y2R2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPN22Q9Y2R2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTPN22Q9Y2R2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPN22Q9Y2R2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPN22Q9Y2R2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTPN22Q9Y2R2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPN22Q9Y2R2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPN22Q9Y2R2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPN22Q9Y2R2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTPN22Q9Y2R2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPN22Q9Y2R2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPN22Q9Y2R2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPN22Q9Y2R2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPN22Q9Y2R2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPN22Q9Y2R2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTPN22Q9Y2R2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPN22Q9Y2R2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPN22Q9Y2R2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPN22Q9Y2R2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTPN22Q9Y2R2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPN22Q9Y2R2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPN22Q9Y2R2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPN22Q9Y2R2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPN22Q9Y2R2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
PTPN22Q9Y2R2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPN22Q9Y2R2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPN22Q9Y2R2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTPN22Q9Y2R2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPN22Q9Y2R2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPN22Q9Y2R2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PTPN22Q9Y2R2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPN22Q9Y2R2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTPN22Q9Y2R2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPN22Q9Y2R2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPN22Q9Y2R2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPN22Q9Y2R2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTPN22Q9Y2R2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPN22Q9Y2R2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTPN22Q9Y2R2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPN22Q9Y2R2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPN22Q9Y2R2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPN22Q9Y2R2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPN22Q9Y2R2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPN22Q9Y2R2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPN22Q9Y2R2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPN22Q9Y2R2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PTPN22Q9Y2R2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPN22Q9Y2R2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPN22Q9Y2R2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPN22Q9Y2R2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTPN22Q9Y2R2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPN22Q9Y2R2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPN22Q9Y2R2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTPN22Q9Y2R2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPN22Q9Y2R2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPN22Q9Y2R2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPN22Q9Y2R2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTPN22Q9Y2R2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPN22Q9Y2R2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPN22Q9Y2R2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPN22Q9Y2R2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPN22Q9Y2R2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPN22Q9Y2R2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPN22Q9Y2R2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PTPN22Q9Y2R2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPN22Q9Y2R2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PTPN22Q9Y2R2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PTPN22Q9Y2R2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPN22Q9Y2R2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPN22Q9Y2R2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PTPN22Q9Y2R2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPN22Q9Y2R2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTPN22Q9Y2R2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTPN22Q9Y2R2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms