Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ35

SRRM2, Serine/arginine repetitive matrix protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM2Q9UQ35 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRM2Q9UQ35 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRM2Q9UQ35 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRM2Q9UQ35 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRM2Q9UQ35 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRM2Q9UQ35 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRM2Q9UQ35 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRM2Q9UQ35 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRM2Q9UQ35 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRM2Q9UQ35 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRM2Q9UQ35 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRRM2Q9UQ35 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM2Q9UQ35 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM2Q9UQ35 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM2Q9UQ35 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRRM2Q9UQ35 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM2Q9UQ35 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM2Q9UQ35 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM2Q9UQ35 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM2Q9UQ35 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM2Q9UQ35 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM2Q9UQ35 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRRM2Q9UQ35 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM2Q9UQ35 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM2Q9UQ35 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SRRM2Q9UQ35 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRRM2Q9UQ35 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRRM2Q9UQ35 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SRRM2Q9UQ35 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM2Q9UQ35 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM2Q9UQ35 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM2Q9UQ35 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SRRM2Q9UQ35 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM2Q9UQ35 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM2Q9UQ35 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM2Q9UQ35 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM2Q9UQ35 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SRRM2Q9UQ35 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRRM2Q9UQ35 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SRRM2Q9UQ35 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRRM2Q9UQ35 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRRM2Q9UQ35 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRRM2Q9UQ35 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SRRM2Q9UQ35 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRRM2Q9UQ35 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRRM2Q9UQ35 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRRM2Q9UQ35 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRRM2Q9UQ35 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRRM2Q9UQ35 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SRRM2Q9UQ35 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM2Q9UQ35 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM2Q9UQ35 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM2Q9UQ35 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM2Q9UQ35 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM2Q9UQ35 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRRM2Q9UQ35 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM2Q9UQ35 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM2Q9UQ35 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM2Q9UQ35 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM2Q9UQ35 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM2Q9UQ35 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM2Q9UQ35 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SRRM2Q9UQ35 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRM2Q9UQ35 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRM2Q9UQ35 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRM2Q9UQ35 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRRM2Q9UQ35 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRRM2Q9UQ35 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRRM2Q9UQ35 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRRM2Q9UQ35 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRRM2Q9UQ35 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRRM2Q9UQ35 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRRM2Q9UQ35 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SRRM2Q9UQ35 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM2Q9UQ35 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM2Q9UQ35 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SRRM2Q9UQ35 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM2Q9UQ35 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM2Q9UQ35 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SRRM2Q9UQ35 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SRRM2Q9UQ35 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM2Q9UQ35 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM2Q9UQ35 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM2Q9UQ35 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM2Q9UQ35 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM2Q9UQ35 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM2Q9UQ35 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM2Q9UQ35 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM2Q9UQ35 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM2Q9UQ35 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SRRM2Q9UQ35 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM2Q9UQ35 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM2Q9UQ35 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM2Q9UQ35 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM2Q9UQ35 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM2Q9UQ35 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SRRM2Q9UQ35 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM2Q9UQ35 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM2Q9UQ35 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SRRM2Q9UQ35 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms