Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
SETD1BQ9UPS6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
SETD1BQ9UPS6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
SETD1BQ9UPS6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
SETD1BQ9UPS6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
SETD1BQ9UPS6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
SETD1BQ9UPS6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
SETD1BQ9UPS6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
SETD1BQ9UPS6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
SETD1BQ9UPS6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
SETD1BQ9UPS6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
SETD1BQ9UPS6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
SETD1BQ9UPS6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
SETD1BQ9UPS6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
SETD1BQ9UPS6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
SETD1BQ9UPS6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
SETD1BQ9UPS6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
SETD1BQ9UPS6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
SETD1BQ9UPS6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
SETD1BQ9UPS6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
SETD1BQ9UPS6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
SETD1BQ9UPS6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
SETD1BQ9UPS6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
SETD1BQ9UPS6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
SETD1BQ9UPS6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
SETD1BQ9UPS6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
SETD1BQ9UPS6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
SETD1BQ9UPS6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
SETD1BQ9UPS6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
SETD1BQ9UPS6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
SETD1BQ9UPS6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
SETD1BQ9UPS6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
SETD1BQ9UPS6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
SETD1BQ9UPS6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
SETD1BQ9UPS6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
SETD1BQ9UPS6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
SETD1BQ9UPS6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
SETD1BQ9UPS6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
SETD1BQ9UPS6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
SETD1BQ9UPS6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
SETD1BQ9UPS6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
SETD1BQ9UPS6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
SETD1BQ9UPS6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
SETD1BQ9UPS6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
SETD1BQ9UPS6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
SETD1BQ9UPS6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
SETD1BQ9UPS6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
SETD1BQ9UPS6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
SETD1BQ9UPS6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
SETD1BQ9UPS6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
SETD1BQ9UPS6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
SETD1BQ9UPS6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
SETD1BQ9UPS6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
SETD1BQ9UPS6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
SETD1BQ9UPS6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
SETD1BQ9UPS6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
SETD1BQ9UPS6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
SETD1BQ9UPS6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
SETD1BQ9UPS6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
SETD1BQ9UPS6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
SETD1BQ9UPS6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
SETD1BQ9UPS6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
SETD1BQ9UPS6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
SETD1BQ9UPS6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
SETD1BQ9UPS6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
SETD1BQ9UPS6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
SETD1BQ9UPS6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
SETD1BQ9UPS6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
SETD1BQ9UPS6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
SETD1BQ9UPS6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
SETD1BQ9UPS6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
SETD1BQ9UPS6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
SETD1BQ9UPS6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
SETD1BQ9UPS6 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
SETD1BQ9UPS6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
SETD1BQ9UPS6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
SETD1BQ9UPS6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
SETD1BQ9UPS6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
SETD1BQ9UPS6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
SETD1BQ9UPS6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
SETD1BQ9UPS6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
SETD1BQ9UPS6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
SETD1BQ9UPS6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
SETD1BQ9UPS6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
SETD1BQ9UPS6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
SETD1BQ9UPS6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
SETD1BQ9UPS6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
SETD1BQ9UPS6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
SETD1BQ9UPS6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
SETD1BQ9UPS6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
SETD1BQ9UPS6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
SETD1BQ9UPS6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.59
SETD1BQ9UPS6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
SETD1BQ9UPS6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
SETD1BQ9UPS6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
SETD1BQ9UPS6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
SETD1BQ9UPS6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
SETD1BQ9UPS6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
SETD1BQ9UPS6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
SETD1BQ9UPS6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms