Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATPIF1Q9UII2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATPIF1Q9UII2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATPIF1Q9UII2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATPIF1Q9UII2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATPIF1Q9UII2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATPIF1Q9UII2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATPIF1Q9UII2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATPIF1Q9UII2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATPIF1Q9UII2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATPIF1Q9UII2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATPIF1Q9UII2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATPIF1Q9UII2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATPIF1Q9UII2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATPIF1Q9UII2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATPIF1Q9UII2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATPIF1Q9UII2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATPIF1Q9UII2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATPIF1Q9UII2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATPIF1Q9UII2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATPIF1Q9UII2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATPIF1Q9UII2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATPIF1Q9UII2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATPIF1Q9UII2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATPIF1Q9UII2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATPIF1Q9UII2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATPIF1Q9UII2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATPIF1Q9UII2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATPIF1Q9UII2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATPIF1Q9UII2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATPIF1Q9UII2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATPIF1Q9UII2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATPIF1Q9UII2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATPIF1Q9UII2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATPIF1Q9UII2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATPIF1Q9UII2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATPIF1Q9UII2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATPIF1Q9UII2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATPIF1Q9UII2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATPIF1Q9UII2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATPIF1Q9UII2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATPIF1Q9UII2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATPIF1Q9UII2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATPIF1Q9UII2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATPIF1Q9UII2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATPIF1Q9UII2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATPIF1Q9UII2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATPIF1Q9UII2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATPIF1Q9UII2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATPIF1Q9UII2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATPIF1Q9UII2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATPIF1Q9UII2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATPIF1Q9UII2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATPIF1Q9UII2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATPIF1Q9UII2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATPIF1Q9UII2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATPIF1Q9UII2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATPIF1Q9UII2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATPIF1Q9UII2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATPIF1Q9UII2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATPIF1Q9UII2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATPIF1Q9UII2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATPIF1Q9UII2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATPIF1Q9UII2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATPIF1Q9UII2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATPIF1Q9UII2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATPIF1Q9UII2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATPIF1Q9UII2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATPIF1Q9UII2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATPIF1Q9UII2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATPIF1Q9UII2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATPIF1Q9UII2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATPIF1Q9UII2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATPIF1Q9UII2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATPIF1Q9UII2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATPIF1Q9UII2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATPIF1Q9UII2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATPIF1Q9UII2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATPIF1Q9UII2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATPIF1Q9UII2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATPIF1Q9UII2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATPIF1Q9UII2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATPIF1Q9UII2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATPIF1Q9UII2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATPIF1Q9UII2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATPIF1Q9UII2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATPIF1Q9UII2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATPIF1Q9UII2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATPIF1Q9UII2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATPIF1Q9UII2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATPIF1Q9UII2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATPIF1Q9UII2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATPIF1Q9UII2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATPIF1Q9UII2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATPIF1Q9UII2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATPIF1Q9UII2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATPIF1Q9UII2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATPIF1Q9UII2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATPIF1Q9UII2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATPIF1Q9UII2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.8 ms