Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA2

SS18L2, SS18-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L2Q9UHA2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SS18L2Q9UHA2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SS18L2Q9UHA2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SS18L2Q9UHA2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SS18L2Q9UHA2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SS18L2Q9UHA2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SS18L2Q9UHA2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SS18L2Q9UHA2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SS18L2Q9UHA2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SS18L2Q9UHA2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SS18L2Q9UHA2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SS18L2Q9UHA2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SS18L2Q9UHA2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SS18L2Q9UHA2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SS18L2Q9UHA2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SS18L2Q9UHA2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SS18L2Q9UHA2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SS18L2Q9UHA2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SS18L2Q9UHA2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SS18L2Q9UHA2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SS18L2Q9UHA2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SS18L2Q9UHA2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SS18L2Q9UHA2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SS18L2Q9UHA2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SS18L2Q9UHA2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SS18L2Q9UHA2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SS18L2Q9UHA2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SS18L2Q9UHA2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SS18L2Q9UHA2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SS18L2Q9UHA2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SS18L2Q9UHA2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SS18L2Q9UHA2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SS18L2Q9UHA2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SS18L2Q9UHA2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SS18L2Q9UHA2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SS18L2Q9UHA2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SS18L2Q9UHA2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SS18L2Q9UHA2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SS18L2Q9UHA2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SS18L2Q9UHA2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SS18L2Q9UHA2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SS18L2Q9UHA2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SS18L2Q9UHA2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SS18L2Q9UHA2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SS18L2Q9UHA2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SS18L2Q9UHA2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SS18L2Q9UHA2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SS18L2Q9UHA2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SS18L2Q9UHA2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SS18L2Q9UHA2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SS18L2Q9UHA2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SS18L2Q9UHA2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SS18L2Q9UHA2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SS18L2Q9UHA2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SS18L2Q9UHA2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SS18L2Q9UHA2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SS18L2Q9UHA2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SS18L2Q9UHA2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SS18L2Q9UHA2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SS18L2Q9UHA2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SS18L2Q9UHA2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SS18L2Q9UHA2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SS18L2Q9UHA2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SS18L2Q9UHA2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SS18L2Q9UHA2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SS18L2Q9UHA2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SS18L2Q9UHA2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SS18L2Q9UHA2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SS18L2Q9UHA2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SS18L2Q9UHA2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SS18L2Q9UHA2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SS18L2Q9UHA2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SS18L2Q9UHA2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SS18L2Q9UHA2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SS18L2Q9UHA2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SS18L2Q9UHA2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SS18L2Q9UHA2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SS18L2Q9UHA2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SS18L2Q9UHA2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SS18L2Q9UHA2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SS18L2Q9UHA2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SS18L2Q9UHA2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SS18L2Q9UHA2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SS18L2Q9UHA2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SS18L2Q9UHA2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SS18L2Q9UHA2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SS18L2Q9UHA2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SS18L2Q9UHA2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SS18L2Q9UHA2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SS18L2Q9UHA2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SS18L2Q9UHA2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SS18L2Q9UHA2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SS18L2Q9UHA2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SS18L2Q9UHA2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SS18L2Q9UHA2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SS18L2Q9UHA2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SS18L2Q9UHA2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SS18L2Q9UHA2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SS18L2Q9UHA2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SS18L2Q9UHA2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms