Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DKK4Q9UBT3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DKK4Q9UBT3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DKK4Q9UBT3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DKK4Q9UBT3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DKK4Q9UBT3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DKK4Q9UBT3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DKK4Q9UBT3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DKK4Q9UBT3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DKK4Q9UBT3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DKK4Q9UBT3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DKK4Q9UBT3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DKK4Q9UBT3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DKK4Q9UBT3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
DKK4Q9UBT3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DKK4Q9UBT3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DKK4Q9UBT3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DKK4Q9UBT3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DKK4Q9UBT3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DKK4Q9UBT3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DKK4Q9UBT3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DKK4Q9UBT3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DKK4Q9UBT3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DKK4Q9UBT3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DKK4Q9UBT3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DKK4Q9UBT3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DKK4Q9UBT3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DKK4Q9UBT3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DKK4Q9UBT3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DKK4Q9UBT3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
DKK4Q9UBT3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
DKK4Q9UBT3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DKK4Q9UBT3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DKK4Q9UBT3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DKK4Q9UBT3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DKK4Q9UBT3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DKK4Q9UBT3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DKK4Q9UBT3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
DKK4Q9UBT3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DKK4Q9UBT3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DKK4Q9UBT3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DKK4Q9UBT3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DKK4Q9UBT3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DKK4Q9UBT3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DKK4Q9UBT3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DKK4Q9UBT3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DKK4Q9UBT3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
DKK4Q9UBT3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DKK4Q9UBT3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
DKK4Q9UBT3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DKK4Q9UBT3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DKK4Q9UBT3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DKK4Q9UBT3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DKK4Q9UBT3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DKK4Q9UBT3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DKK4Q9UBT3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
DKK4Q9UBT3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
DKK4Q9UBT3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DKK4Q9UBT3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DKK4Q9UBT3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DKK4Q9UBT3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
DKK4Q9UBT3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DKK4Q9UBT3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
DKK4Q9UBT3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DKK4Q9UBT3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
DKK4Q9UBT3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DKK4Q9UBT3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DKK4Q9UBT3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DKK4Q9UBT3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DKK4Q9UBT3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DKK4Q9UBT3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DKK4Q9UBT3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DKK4Q9UBT3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DKK4Q9UBT3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DKK4Q9UBT3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DKK4Q9UBT3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DKK4Q9UBT3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DKK4Q9UBT3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DKK4Q9UBT3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DKK4Q9UBT3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DKK4Q9UBT3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DKK4Q9UBT3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
DKK4Q9UBT3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DKK4Q9UBT3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DKK4Q9UBT3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DKK4Q9UBT3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DKK4Q9UBT3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DKK4Q9UBT3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DKK4Q9UBT3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DKK4Q9UBT3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DKK4Q9UBT3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DKK4Q9UBT3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DKK4Q9UBT3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DKK4Q9UBT3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DKK4Q9UBT3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DKK4Q9UBT3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DKK4Q9UBT3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DKK4Q9UBT3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DKK4Q9UBT3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DKK4Q9UBT3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms