Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPASTQ9UBP0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SPASTQ9UBP0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SPASTQ9UBP0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPASTQ9UBP0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPASTQ9UBP0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPASTQ9UBP0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPASTQ9UBP0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPASTQ9UBP0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPASTQ9UBP0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPASTQ9UBP0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SPASTQ9UBP0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPASTQ9UBP0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPASTQ9UBP0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SPASTQ9UBP0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPASTQ9UBP0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPASTQ9UBP0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPASTQ9UBP0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPASTQ9UBP0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPASTQ9UBP0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPASTQ9UBP0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPASTQ9UBP0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPASTQ9UBP0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SPASTQ9UBP0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPASTQ9UBP0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPASTQ9UBP0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPASTQ9UBP0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPASTQ9UBP0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPASTQ9UBP0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPASTQ9UBP0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPASTQ9UBP0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPASTQ9UBP0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPASTQ9UBP0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPASTQ9UBP0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPASTQ9UBP0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPASTQ9UBP0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SPASTQ9UBP0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPASTQ9UBP0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPASTQ9UBP0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPASTQ9UBP0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPASTQ9UBP0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPASTQ9UBP0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPASTQ9UBP0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SPASTQ9UBP0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPASTQ9UBP0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPASTQ9UBP0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPASTQ9UBP0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPASTQ9UBP0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPASTQ9UBP0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPASTQ9UBP0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPASTQ9UBP0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPASTQ9UBP0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SPASTQ9UBP0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPASTQ9UBP0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPASTQ9UBP0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPASTQ9UBP0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPASTQ9UBP0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPASTQ9UBP0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPASTQ9UBP0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPASTQ9UBP0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SPASTQ9UBP0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPASTQ9UBP0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPASTQ9UBP0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPASTQ9UBP0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPASTQ9UBP0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPASTQ9UBP0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPASTQ9UBP0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPASTQ9UBP0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPASTQ9UBP0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPASTQ9UBP0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPASTQ9UBP0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPASTQ9UBP0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPASTQ9UBP0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPASTQ9UBP0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPASTQ9UBP0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPASTQ9UBP0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPASTQ9UBP0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPASTQ9UBP0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SPASTQ9UBP0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPASTQ9UBP0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPASTQ9UBP0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPASTQ9UBP0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPASTQ9UBP0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPASTQ9UBP0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPASTQ9UBP0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPASTQ9UBP0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPASTQ9UBP0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SPASTQ9UBP0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPASTQ9UBP0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPASTQ9UBP0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPASTQ9UBP0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPASTQ9UBP0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPASTQ9UBP0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPASTQ9UBP0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPASTQ9UBP0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPASTQ9UBP0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPASTQ9UBP0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPASTQ9UBP0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPASTQ9UBP0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPASTQ9UBP0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.6 ms