Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC9

SPRR3, Small proline-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR3Q9UBC9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPRR3Q9UBC9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPRR3Q9UBC9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SPRR3Q9UBC9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPRR3Q9UBC9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPRR3Q9UBC9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPRR3Q9UBC9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPRR3Q9UBC9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPRR3Q9UBC9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPRR3Q9UBC9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPRR3Q9UBC9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPRR3Q9UBC9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPRR3Q9UBC9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPRR3Q9UBC9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPRR3Q9UBC9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPRR3Q9UBC9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPRR3Q9UBC9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPRR3Q9UBC9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPRR3Q9UBC9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPRR3Q9UBC9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPRR3Q9UBC9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPRR3Q9UBC9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPRR3Q9UBC9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPRR3Q9UBC9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPRR3Q9UBC9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SPRR3Q9UBC9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPRR3Q9UBC9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPRR3Q9UBC9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPRR3Q9UBC9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPRR3Q9UBC9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPRR3Q9UBC9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SPRR3Q9UBC9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SPRR3Q9UBC9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPRR3Q9UBC9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPRR3Q9UBC9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPRR3Q9UBC9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SPRR3Q9UBC9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPRR3Q9UBC9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPRR3Q9UBC9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPRR3Q9UBC9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPRR3Q9UBC9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPRR3Q9UBC9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SPRR3Q9UBC9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPRR3Q9UBC9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPRR3Q9UBC9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPRR3Q9UBC9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPRR3Q9UBC9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPRR3Q9UBC9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SPRR3Q9UBC9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SPRR3Q9UBC9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPRR3Q9UBC9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPRR3Q9UBC9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPRR3Q9UBC9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPRR3Q9UBC9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPRR3Q9UBC9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPRR3Q9UBC9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPRR3Q9UBC9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPRR3Q9UBC9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPRR3Q9UBC9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPRR3Q9UBC9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPRR3Q9UBC9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPRR3Q9UBC9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SPRR3Q9UBC9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPRR3Q9UBC9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPRR3Q9UBC9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPRR3Q9UBC9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SPRR3Q9UBC9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPRR3Q9UBC9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SPRR3Q9UBC9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPRR3Q9UBC9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPRR3Q9UBC9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPRR3Q9UBC9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPRR3Q9UBC9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPRR3Q9UBC9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPRR3Q9UBC9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPRR3Q9UBC9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPRR3Q9UBC9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SPRR3Q9UBC9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPRR3Q9UBC9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPRR3Q9UBC9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPRR3Q9UBC9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPRR3Q9UBC9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPRR3Q9UBC9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPRR3Q9UBC9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPRR3Q9UBC9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPRR3Q9UBC9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SPRR3Q9UBC9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPRR3Q9UBC9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPRR3Q9UBC9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPRR3Q9UBC9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPRR3Q9UBC9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPRR3Q9UBC9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPRR3Q9UBC9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPRR3Q9UBC9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPRR3Q9UBC9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPRR3Q9UBC9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPRR3Q9UBC9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPRR3Q9UBC9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPRR3Q9UBC9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPRR3Q9UBC9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms