Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC38.96■■■■□ 3.83
RRBP1Q9P2E9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
RRBP1Q9P2E9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC38.96■■■■□ 3.83
RRBP1Q9P2E9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
RRBP1Q9P2E9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
RRBP1Q9P2E9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.82
RRBP1Q9P2E9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
RRBP1Q9P2E9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
RRBP1Q9P2E9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
RRBP1Q9P2E9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
RRBP1Q9P2E9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
RRBP1Q9P2E9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
RRBP1Q9P2E9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
RRBP1Q9P2E9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
RRBP1Q9P2E9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
RRBP1Q9P2E9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
RRBP1Q9P2E9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC38.89■■■■□ 3.82
RRBP1Q9P2E9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
RRBP1Q9P2E9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
RRBP1Q9P2E9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
RRBP1Q9P2E9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
RRBP1Q9P2E9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
RRBP1Q9P2E9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
RRBP1Q9P2E9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
RRBP1Q9P2E9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
RRBP1Q9P2E9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
RRBP1Q9P2E9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
RRBP1Q9P2E9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
RRBP1Q9P2E9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
RRBP1Q9P2E9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
RRBP1Q9P2E9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
RRBP1Q9P2E9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
RRBP1Q9P2E9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
RRBP1Q9P2E9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
RRBP1Q9P2E9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC38.82■■■■□ 3.81
RRBP1Q9P2E9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.81
RRBP1Q9P2E9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
RRBP1Q9P2E9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
RRBP1Q9P2E9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
RRBP1Q9P2E9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
RRBP1Q9P2E9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
RRBP1Q9P2E9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
RRBP1Q9P2E9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
RRBP1Q9P2E9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
RRBP1Q9P2E9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
RRBP1Q9P2E9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
RRBP1Q9P2E9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.8
RRBP1Q9P2E9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
RRBP1Q9P2E9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.8
RRBP1Q9P2E9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
RRBP1Q9P2E9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC38.75■■■■□ 3.79
RRBP1Q9P2E9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
RRBP1Q9P2E9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC38.75■■■■□ 3.79
RRBP1Q9P2E9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.75■■■■□ 3.79
RRBP1Q9P2E9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
RRBP1Q9P2E9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
RRBP1Q9P2E9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
RRBP1Q9P2E9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
RRBP1Q9P2E9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC38.74■■■■□ 3.79
RRBP1Q9P2E9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
RRBP1Q9P2E9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
RRBP1Q9P2E9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
RRBP1Q9P2E9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
RRBP1Q9P2E9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
RRBP1Q9P2E9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
RRBP1Q9P2E9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
RRBP1Q9P2E9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
RRBP1Q9P2E9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC38.68■■■■□ 3.78
RRBP1Q9P2E9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC38.68■■■■□ 3.78
RRBP1Q9P2E9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
RRBP1Q9P2E9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
RRBP1Q9P2E9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
RRBP1Q9P2E9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
RRBP1Q9P2E9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
RRBP1Q9P2E9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.66■■■■□ 3.78
RRBP1Q9P2E9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
RRBP1Q9P2E9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
RRBP1Q9P2E9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
RRBP1Q9P2E9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
RRBP1Q9P2E9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
RRBP1Q9P2E9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
RRBP1Q9P2E9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
RRBP1Q9P2E9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
RRBP1Q9P2E9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
RRBP1Q9P2E9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
RRBP1Q9P2E9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.77
RRBP1Q9P2E9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
RRBP1Q9P2E9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
RRBP1Q9P2E9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
RRBP1Q9P2E9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
RRBP1Q9P2E9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
RRBP1Q9P2E9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
RRBP1Q9P2E9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
RRBP1Q9P2E9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC38.59■■■■□ 3.77
RRBP1Q9P2E9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
RRBP1Q9P2E9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC38.58■■■■□ 3.77
RRBP1Q9P2E9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
RRBP1Q9P2E9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
RRBP1Q9P2E9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC38.58■■■■□ 3.77
RRBP1Q9P2E9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms