Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.52■■■■■ 6.16
CCDC180Q9P1Z9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC53.51■■■■■ 6.16
CCDC180Q9P1Z9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC53.5■■■■■ 6.16
CCDC180Q9P1Z9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC53.5■■■■■ 6.15
CCDC180Q9P1Z9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC53.49■■■■■ 6.15
CCDC180Q9P1Z9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC53.49■■■■■ 6.15
CCDC180Q9P1Z9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC53.48■■■■■ 6.15
CCDC180Q9P1Z9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC53.48■■■■■ 6.15
CCDC180Q9P1Z9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC53.47■■■■■ 6.15
CCDC180Q9P1Z9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC53.47■■■■■ 6.15
CCDC180Q9P1Z9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.47■■■■■ 6.15
CCDC180Q9P1Z9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC53.46■■■■■ 6.15
CCDC180Q9P1Z9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC53.46■■■■■ 6.15
CCDC180Q9P1Z9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC53.44■■■■■ 6.15
CCDC180Q9P1Z9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC53.44■■■■■ 6.14
CCDC180Q9P1Z9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.43■■■■■ 6.14
CCDC180Q9P1Z9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC53.43■■■■■ 6.14
CCDC180Q9P1Z9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC53.43■■■■■ 6.14
CCDC180Q9P1Z9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC53.42■■■■■ 6.14
CCDC180Q9P1Z9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.42■■■■■ 6.14
CCDC180Q9P1Z9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.4■■■■■ 6.14
CCDC180Q9P1Z9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC53.4■■■■■ 6.14
CCDC180Q9P1Z9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC53.39■■■■■ 6.14
CCDC180Q9P1Z9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC53.39■■■■■ 6.14
CCDC180Q9P1Z9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC53.39■■■■■ 6.14
CCDC180Q9P1Z9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC53.39■■■■■ 6.14
CCDC180Q9P1Z9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC53.39■■■■■ 6.14
CCDC180Q9P1Z9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.37■■■■■ 6.13
CCDC180Q9P1Z9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC53.34■■■■■ 6.13
CCDC180Q9P1Z9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC53.34■■■■■ 6.13
CCDC180Q9P1Z9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC53.33■■■■■ 6.13
CCDC180Q9P1Z9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC53.33■■■■■ 6.13
CCDC180Q9P1Z9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC53.32■■■■■ 6.13
CCDC180Q9P1Z9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC53.32■■■■■ 6.13
CCDC180Q9P1Z9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.32■■■■■ 6.13
CCDC180Q9P1Z9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC53.3■■■■■ 6.12
CCDC180Q9P1Z9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC53.3■■■■■ 6.12
CCDC180Q9P1Z9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.29■■■■■ 6.12
CCDC180Q9P1Z9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC53.29■■■■■ 6.12
CCDC180Q9P1Z9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC53.28■■■■■ 6.12
CCDC180Q9P1Z9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC53.27■■■■■ 6.12
CCDC180Q9P1Z9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC53.25■■■■■ 6.12
CCDC180Q9P1Z9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC53.25■■■■■ 6.12
CCDC180Q9P1Z9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC53.24■■■■■ 6.11
CCDC180Q9P1Z9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.24■■■■■ 6.11
CCDC180Q9P1Z9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC53.23■■■■■ 6.11
CCDC180Q9P1Z9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC53.23■■■■■ 6.11
CCDC180Q9P1Z9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC53.22■■■■■ 6.11
CCDC180Q9P1Z9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.21■■■■■ 6.11
CCDC180Q9P1Z9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC53.21■■■■■ 6.11
CCDC180Q9P1Z9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.21■■■■■ 6.11
CCDC180Q9P1Z9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC53.2■■■■■ 6.11
CCDC180Q9P1Z9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC53.2■■■■■ 6.11
CCDC180Q9P1Z9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC53.2■■■■■ 6.11
CCDC180Q9P1Z9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC53.2■■■■■ 6.11
CCDC180Q9P1Z9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC53.2■■■■■ 6.11
CCDC180Q9P1Z9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC53.2■■■■■ 6.11
CCDC180Q9P1Z9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC53.19■■■■■ 6.11
CCDC180Q9P1Z9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC53.18■■■■■ 6.1
CCDC180Q9P1Z9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC53.18■■■■■ 6.1
CCDC180Q9P1Z9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC53.17■■■■■ 6.1
CCDC180Q9P1Z9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC53.17■■■■■ 6.1
CCDC180Q9P1Z9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC53.17■■■■■ 6.1
CCDC180Q9P1Z9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.17■■■■■ 6.1
CCDC180Q9P1Z9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC53.17■■■■■ 6.1
CCDC180Q9P1Z9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC53.16■■■■■ 6.1
CCDC180Q9P1Z9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC53.16■■■■■ 6.1
CCDC180Q9P1Z9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.16■■■■■ 6.1
CCDC180Q9P1Z9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC53.13■■■■■ 6.1
CCDC180Q9P1Z9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC53.13■■■■■ 6.1
CCDC180Q9P1Z9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC53.13■■■■■ 6.1
CCDC180Q9P1Z9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC53.12■■■■■ 6.09
CCDC180Q9P1Z9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC53.11■■■■■ 6.09
CCDC180Q9P1Z9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC53.09■■■■■ 6.09
CCDC180Q9P1Z9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.08■■■■■ 6.09
CCDC180Q9P1Z9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC53.08■■■■■ 6.09
CCDC180Q9P1Z9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC53.07■■■■■ 6.09
CCDC180Q9P1Z9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC53.07■■■■■ 6.09
CCDC180Q9P1Z9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC53.07■■■■■ 6.09
CCDC180Q9P1Z9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.05■■■■■ 6.08
CCDC180Q9P1Z9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC53.05■■■■■ 6.08
CCDC180Q9P1Z9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC53.05■■■■■ 6.08
CCDC180Q9P1Z9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.05■■■■■ 6.08
CCDC180Q9P1Z9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC53.04■■■■■ 6.08
CCDC180Q9P1Z9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC53.03■■■■■ 6.08
CCDC180Q9P1Z9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC53.02■■■■■ 6.08
CCDC180Q9P1Z9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC53.02■■■■■ 6.08
CCDC180Q9P1Z9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC53.02■■■■■ 6.08
CCDC180Q9P1Z9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC53.02■■■■■ 6.08
CCDC180Q9P1Z9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC53.01■■■■■ 6.08
CCDC180Q9P1Z9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC53■■■■■ 6.08
CCDC180Q9P1Z9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC53■■■■■ 6.07
CCDC180Q9P1Z9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC53■■■■■ 6.07
CCDC180Q9P1Z9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC53■■■■■ 6.07
CCDC180Q9P1Z9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.99■■■■■ 6.07
CCDC180Q9P1Z9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC52.99■■■■■ 6.07
CCDC180Q9P1Z9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.99■■■■■ 6.07
CCDC180Q9P1Z9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.99■■■■■ 6.07
CCDC180Q9P1Z9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC52.99■■■■■ 6.07
CCDC180Q9P1Z9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC52.98■■■■■ 6.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms