Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PHRF1Q9P1Y6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PHRF1Q9P1Y6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PHRF1Q9P1Y6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PHRF1Q9P1Y6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PHRF1Q9P1Y6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PHRF1Q9P1Y6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PHRF1Q9P1Y6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PHRF1Q9P1Y6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PHRF1Q9P1Y6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PHRF1Q9P1Y6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PHRF1Q9P1Y6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PHRF1Q9P1Y6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PHRF1Q9P1Y6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
PHRF1Q9P1Y6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PHRF1Q9P1Y6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PHRF1Q9P1Y6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
PHRF1Q9P1Y6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PHRF1Q9P1Y6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PHRF1Q9P1Y6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PHRF1Q9P1Y6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PHRF1Q9P1Y6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PHRF1Q9P1Y6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
PHRF1Q9P1Y6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PHRF1Q9P1Y6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PHRF1Q9P1Y6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PHRF1Q9P1Y6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PHRF1Q9P1Y6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PHRF1Q9P1Y6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
PHRF1Q9P1Y6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PHRF1Q9P1Y6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PHRF1Q9P1Y6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
PHRF1Q9P1Y6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
PHRF1Q9P1Y6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
PHRF1Q9P1Y6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PHRF1Q9P1Y6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
PHRF1Q9P1Y6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PHRF1Q9P1Y6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PHRF1Q9P1Y6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
PHRF1Q9P1Y6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
PHRF1Q9P1Y6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
PHRF1Q9P1Y6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PHRF1Q9P1Y6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
PHRF1Q9P1Y6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PHRF1Q9P1Y6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PHRF1Q9P1Y6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
PHRF1Q9P1Y6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PHRF1Q9P1Y6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
PHRF1Q9P1Y6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PHRF1Q9P1Y6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PHRF1Q9P1Y6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PHRF1Q9P1Y6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PHRF1Q9P1Y6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PHRF1Q9P1Y6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PHRF1Q9P1Y6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PHRF1Q9P1Y6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PHRF1Q9P1Y6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PHRF1Q9P1Y6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PHRF1Q9P1Y6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PHRF1Q9P1Y6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PHRF1Q9P1Y6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PHRF1Q9P1Y6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PHRF1Q9P1Y6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PHRF1Q9P1Y6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PHRF1Q9P1Y6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PHRF1Q9P1Y6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
PHRF1Q9P1Y6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
PHRF1Q9P1Y6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PHRF1Q9P1Y6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PHRF1Q9P1Y6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PHRF1Q9P1Y6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PHRF1Q9P1Y6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PHRF1Q9P1Y6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PHRF1Q9P1Y6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
PHRF1Q9P1Y6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PHRF1Q9P1Y6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PHRF1Q9P1Y6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PHRF1Q9P1Y6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
PHRF1Q9P1Y6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PHRF1Q9P1Y6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PHRF1Q9P1Y6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
PHRF1Q9P1Y6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
PHRF1Q9P1Y6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PHRF1Q9P1Y6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PHRF1Q9P1Y6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PHRF1Q9P1Y6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PHRF1Q9P1Y6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PHRF1Q9P1Y6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PHRF1Q9P1Y6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PHRF1Q9P1Y6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PHRF1Q9P1Y6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PHRF1Q9P1Y6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PHRF1Q9P1Y6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PHRF1Q9P1Y6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
PHRF1Q9P1Y6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PHRF1Q9P1Y6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
PHRF1Q9P1Y6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PHRF1Q9P1Y6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
PHRF1Q9P1Y6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PHRF1Q9P1Y6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms