Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1F3

ABRACL, Costars family protein ABRACL, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRACLQ9P1F3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABRACLQ9P1F3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABRACLQ9P1F3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABRACLQ9P1F3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABRACLQ9P1F3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABRACLQ9P1F3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABRACLQ9P1F3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABRACLQ9P1F3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABRACLQ9P1F3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABRACLQ9P1F3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABRACLQ9P1F3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABRACLQ9P1F3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABRACLQ9P1F3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABRACLQ9P1F3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABRACLQ9P1F3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABRACLQ9P1F3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABRACLQ9P1F3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABRACLQ9P1F3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABRACLQ9P1F3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABRACLQ9P1F3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABRACLQ9P1F3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABRACLQ9P1F3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ABRACLQ9P1F3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ABRACLQ9P1F3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABRACLQ9P1F3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABRACLQ9P1F3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ABRACLQ9P1F3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABRACLQ9P1F3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ABRACLQ9P1F3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ABRACLQ9P1F3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ABRACLQ9P1F3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ABRACLQ9P1F3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABRACLQ9P1F3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABRACLQ9P1F3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABRACLQ9P1F3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ABRACLQ9P1F3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ABRACLQ9P1F3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABRACLQ9P1F3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABRACLQ9P1F3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABRACLQ9P1F3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ABRACLQ9P1F3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABRACLQ9P1F3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ABRACLQ9P1F3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABRACLQ9P1F3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ABRACLQ9P1F3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ABRACLQ9P1F3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABRACLQ9P1F3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABRACLQ9P1F3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABRACLQ9P1F3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ABRACLQ9P1F3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ABRACLQ9P1F3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABRACLQ9P1F3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABRACLQ9P1F3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ABRACLQ9P1F3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABRACLQ9P1F3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABRACLQ9P1F3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABRACLQ9P1F3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABRACLQ9P1F3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABRACLQ9P1F3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ABRACLQ9P1F3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABRACLQ9P1F3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABRACLQ9P1F3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABRACLQ9P1F3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ABRACLQ9P1F3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABRACLQ9P1F3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABRACLQ9P1F3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABRACLQ9P1F3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABRACLQ9P1F3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABRACLQ9P1F3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ABRACLQ9P1F3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABRACLQ9P1F3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABRACLQ9P1F3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ABRACLQ9P1F3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABRACLQ9P1F3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABRACLQ9P1F3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABRACLQ9P1F3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABRACLQ9P1F3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ABRACLQ9P1F3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ABRACLQ9P1F3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABRACLQ9P1F3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABRACLQ9P1F3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABRACLQ9P1F3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABRACLQ9P1F3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ABRACLQ9P1F3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABRACLQ9P1F3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABRACLQ9P1F3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABRACLQ9P1F3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABRACLQ9P1F3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABRACLQ9P1F3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABRACLQ9P1F3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABRACLQ9P1F3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ABRACLQ9P1F3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABRACLQ9P1F3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ABRACLQ9P1F3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABRACLQ9P1F3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABRACLQ9P1F3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABRACLQ9P1F3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ABRACLQ9P1F3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ABRACLQ9P1F3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ABRACLQ9P1F3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms