Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J0

NDUFA13, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA13Q9P0J0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDUFA13Q9P0J0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDUFA13Q9P0J0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDUFA13Q9P0J0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDUFA13Q9P0J0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDUFA13Q9P0J0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDUFA13Q9P0J0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDUFA13Q9P0J0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDUFA13Q9P0J0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDUFA13Q9P0J0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDUFA13Q9P0J0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDUFA13Q9P0J0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDUFA13Q9P0J0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDUFA13Q9P0J0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDUFA13Q9P0J0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDUFA13Q9P0J0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDUFA13Q9P0J0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDUFA13Q9P0J0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDUFA13Q9P0J0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDUFA13Q9P0J0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDUFA13Q9P0J0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDUFA13Q9P0J0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDUFA13Q9P0J0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDUFA13Q9P0J0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDUFA13Q9P0J0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDUFA13Q9P0J0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDUFA13Q9P0J0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDUFA13Q9P0J0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDUFA13Q9P0J0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDUFA13Q9P0J0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NDUFA13Q9P0J0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NDUFA13Q9P0J0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NDUFA13Q9P0J0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NDUFA13Q9P0J0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDUFA13Q9P0J0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDUFA13Q9P0J0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDUFA13Q9P0J0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDUFA13Q9P0J0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDUFA13Q9P0J0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDUFA13Q9P0J0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDUFA13Q9P0J0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDUFA13Q9P0J0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDUFA13Q9P0J0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDUFA13Q9P0J0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDUFA13Q9P0J0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDUFA13Q9P0J0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDUFA13Q9P0J0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDUFA13Q9P0J0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDUFA13Q9P0J0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDUFA13Q9P0J0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDUFA13Q9P0J0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDUFA13Q9P0J0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDUFA13Q9P0J0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDUFA13Q9P0J0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDUFA13Q9P0J0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDUFA13Q9P0J0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDUFA13Q9P0J0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDUFA13Q9P0J0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDUFA13Q9P0J0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NDUFA13Q9P0J0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDUFA13Q9P0J0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDUFA13Q9P0J0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDUFA13Q9P0J0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDUFA13Q9P0J0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDUFA13Q9P0J0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDUFA13Q9P0J0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDUFA13Q9P0J0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDUFA13Q9P0J0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDUFA13Q9P0J0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDUFA13Q9P0J0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDUFA13Q9P0J0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDUFA13Q9P0J0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDUFA13Q9P0J0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDUFA13Q9P0J0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDUFA13Q9P0J0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDUFA13Q9P0J0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDUFA13Q9P0J0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDUFA13Q9P0J0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDUFA13Q9P0J0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDUFA13Q9P0J0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDUFA13Q9P0J0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NDUFA13Q9P0J0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDUFA13Q9P0J0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDUFA13Q9P0J0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDUFA13Q9P0J0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDUFA13Q9P0J0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDUFA13Q9P0J0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDUFA13Q9P0J0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDUFA13Q9P0J0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDUFA13Q9P0J0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDUFA13Q9P0J0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NDUFA13Q9P0J0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDUFA13Q9P0J0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDUFA13Q9P0J0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDUFA13Q9P0J0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDUFA13Q9P0J0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDUFA13Q9P0J0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDUFA13Q9P0J0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDUFA13Q9P0J0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NDUFA13Q9P0J0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms