Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HACD3Q9P035 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HACD3Q9P035 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HACD3Q9P035 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HACD3Q9P035 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HACD3Q9P035 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HACD3Q9P035 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HACD3Q9P035 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HACD3Q9P035 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HACD3Q9P035 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HACD3Q9P035 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HACD3Q9P035 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HACD3Q9P035 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HACD3Q9P035 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HACD3Q9P035 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HACD3Q9P035 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HACD3Q9P035 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HACD3Q9P035 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HACD3Q9P035 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HACD3Q9P035 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HACD3Q9P035 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HACD3Q9P035 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HACD3Q9P035 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HACD3Q9P035 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HACD3Q9P035 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HACD3Q9P035 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HACD3Q9P035 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HACD3Q9P035 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.68
HACD3Q9P035 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HACD3Q9P035 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HACD3Q9P035 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HACD3Q9P035 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HACD3Q9P035 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HACD3Q9P035 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HACD3Q9P035 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HACD3Q9P035 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HACD3Q9P035 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HACD3Q9P035 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HACD3Q9P035 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HACD3Q9P035 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HACD3Q9P035 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HACD3Q9P035 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HACD3Q9P035 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HACD3Q9P035 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HACD3Q9P035 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HACD3Q9P035 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HACD3Q9P035 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HACD3Q9P035 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HACD3Q9P035 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HACD3Q9P035 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HACD3Q9P035 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HACD3Q9P035 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HACD3Q9P035 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HACD3Q9P035 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HACD3Q9P035 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HACD3Q9P035 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HACD3Q9P035 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HACD3Q9P035 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
HACD3Q9P035 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HACD3Q9P035 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HACD3Q9P035 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HACD3Q9P035 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HACD3Q9P035 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HACD3Q9P035 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HACD3Q9P035 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HACD3Q9P035 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HACD3Q9P035 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HACD3Q9P035 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HACD3Q9P035 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HACD3Q9P035 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HACD3Q9P035 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HACD3Q9P035 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HACD3Q9P035 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HACD3Q9P035 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HACD3Q9P035 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HACD3Q9P035 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HACD3Q9P035 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HACD3Q9P035 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HACD3Q9P035 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HACD3Q9P035 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HACD3Q9P035 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HACD3Q9P035 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HACD3Q9P035 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HACD3Q9P035 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HACD3Q9P035 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HACD3Q9P035 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HACD3Q9P035 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HACD3Q9P035 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HACD3Q9P035 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HACD3Q9P035 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HACD3Q9P035 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HACD3Q9P035 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HACD3Q9P035 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HACD3Q9P035 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HACD3Q9P035 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HACD3Q9P035 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HACD3Q9P035 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HACD3Q9P035 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HACD3Q9P035 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HACD3Q9P035 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms