Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV7

ZIM2, Zinc finger imprinted 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIM2Q9NZV7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZIM2Q9NZV7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZIM2Q9NZV7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZIM2Q9NZV7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZIM2Q9NZV7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZIM2Q9NZV7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZIM2Q9NZV7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZIM2Q9NZV7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZIM2Q9NZV7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZIM2Q9NZV7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZIM2Q9NZV7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZIM2Q9NZV7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZIM2Q9NZV7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZIM2Q9NZV7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZIM2Q9NZV7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZIM2Q9NZV7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZIM2Q9NZV7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZIM2Q9NZV7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZIM2Q9NZV7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZIM2Q9NZV7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZIM2Q9NZV7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZIM2Q9NZV7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZIM2Q9NZV7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZIM2Q9NZV7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZIM2Q9NZV7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZIM2Q9NZV7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZIM2Q9NZV7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZIM2Q9NZV7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZIM2Q9NZV7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZIM2Q9NZV7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZIM2Q9NZV7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZIM2Q9NZV7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZIM2Q9NZV7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZIM2Q9NZV7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZIM2Q9NZV7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZIM2Q9NZV7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZIM2Q9NZV7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZIM2Q9NZV7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZIM2Q9NZV7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZIM2Q9NZV7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZIM2Q9NZV7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZIM2Q9NZV7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZIM2Q9NZV7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZIM2Q9NZV7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZIM2Q9NZV7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZIM2Q9NZV7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZIM2Q9NZV7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZIM2Q9NZV7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZIM2Q9NZV7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZIM2Q9NZV7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZIM2Q9NZV7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZIM2Q9NZV7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZIM2Q9NZV7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZIM2Q9NZV7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZIM2Q9NZV7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZIM2Q9NZV7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZIM2Q9NZV7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZIM2Q9NZV7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZIM2Q9NZV7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZIM2Q9NZV7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZIM2Q9NZV7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZIM2Q9NZV7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ZIM2Q9NZV7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZIM2Q9NZV7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZIM2Q9NZV7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZIM2Q9NZV7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZIM2Q9NZV7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZIM2Q9NZV7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZIM2Q9NZV7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZIM2Q9NZV7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZIM2Q9NZV7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZIM2Q9NZV7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZIM2Q9NZV7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZIM2Q9NZV7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZIM2Q9NZV7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ZIM2Q9NZV7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZIM2Q9NZV7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZIM2Q9NZV7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZIM2Q9NZV7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZIM2Q9NZV7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZIM2Q9NZV7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZIM2Q9NZV7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZIM2Q9NZV7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZIM2Q9NZV7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZIM2Q9NZV7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ZIM2Q9NZV7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZIM2Q9NZV7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZIM2Q9NZV7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ZIM2Q9NZV7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZIM2Q9NZV7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZIM2Q9NZV7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZIM2Q9NZV7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZIM2Q9NZV7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZIM2Q9NZV7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZIM2Q9NZV7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ZIM2Q9NZV7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZIM2Q9NZV7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZIM2Q9NZV7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZIM2Q9NZV7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ZIM2Q9NZV7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms