Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM6

PKD2L2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L2Q9NZM6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PKD2L2Q9NZM6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PKD2L2Q9NZM6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKD2L2Q9NZM6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKD2L2Q9NZM6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKD2L2Q9NZM6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PKD2L2Q9NZM6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PKD2L2Q9NZM6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PKD2L2Q9NZM6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PKD2L2Q9NZM6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKD2L2Q9NZM6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKD2L2Q9NZM6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKD2L2Q9NZM6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKD2L2Q9NZM6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKD2L2Q9NZM6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKD2L2Q9NZM6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PKD2L2Q9NZM6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PKD2L2Q9NZM6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKD2L2Q9NZM6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKD2L2Q9NZM6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PKD2L2Q9NZM6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PKD2L2Q9NZM6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKD2L2Q9NZM6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKD2L2Q9NZM6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKD2L2Q9NZM6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PKD2L2Q9NZM6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKD2L2Q9NZM6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PKD2L2Q9NZM6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKD2L2Q9NZM6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKD2L2Q9NZM6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PKD2L2Q9NZM6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PKD2L2Q9NZM6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKD2L2Q9NZM6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKD2L2Q9NZM6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKD2L2Q9NZM6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PKD2L2Q9NZM6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKD2L2Q9NZM6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PKD2L2Q9NZM6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKD2L2Q9NZM6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKD2L2Q9NZM6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKD2L2Q9NZM6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PKD2L2Q9NZM6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PKD2L2Q9NZM6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PKD2L2Q9NZM6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PKD2L2Q9NZM6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKD2L2Q9NZM6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKD2L2Q9NZM6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PKD2L2Q9NZM6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKD2L2Q9NZM6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKD2L2Q9NZM6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKD2L2Q9NZM6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PKD2L2Q9NZM6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD2L2Q9NZM6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PKD2L2Q9NZM6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKD2L2Q9NZM6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKD2L2Q9NZM6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PKD2L2Q9NZM6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKD2L2Q9NZM6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKD2L2Q9NZM6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKD2L2Q9NZM6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKD2L2Q9NZM6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKD2L2Q9NZM6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKD2L2Q9NZM6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PKD2L2Q9NZM6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKD2L2Q9NZM6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKD2L2Q9NZM6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKD2L2Q9NZM6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKD2L2Q9NZM6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKD2L2Q9NZM6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PKD2L2Q9NZM6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKD2L2Q9NZM6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKD2L2Q9NZM6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PKD2L2Q9NZM6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PKD2L2Q9NZM6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKD2L2Q9NZM6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKD2L2Q9NZM6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PKD2L2Q9NZM6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKD2L2Q9NZM6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PKD2L2Q9NZM6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKD2L2Q9NZM6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKD2L2Q9NZM6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKD2L2Q9NZM6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKD2L2Q9NZM6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PKD2L2Q9NZM6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKD2L2Q9NZM6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PKD2L2Q9NZM6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKD2L2Q9NZM6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKD2L2Q9NZM6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKD2L2Q9NZM6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PKD2L2Q9NZM6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKD2L2Q9NZM6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKD2L2Q9NZM6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKD2L2Q9NZM6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PKD2L2Q9NZM6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PKD2L2Q9NZM6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKD2L2Q9NZM6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKD2L2Q9NZM6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PKD2L2Q9NZM6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKD2L2Q9NZM6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PKD2L2Q9NZM6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms