Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ43

USE1, Vesicle transport protein USE1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USE1Q9NZ43 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USE1Q9NZ43 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USE1Q9NZ43 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USE1Q9NZ43 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USE1Q9NZ43 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USE1Q9NZ43 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USE1Q9NZ43 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USE1Q9NZ43 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USE1Q9NZ43 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USE1Q9NZ43 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USE1Q9NZ43 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USE1Q9NZ43 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USE1Q9NZ43 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USE1Q9NZ43 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USE1Q9NZ43 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USE1Q9NZ43 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USE1Q9NZ43 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USE1Q9NZ43 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
USE1Q9NZ43 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
USE1Q9NZ43 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USE1Q9NZ43 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USE1Q9NZ43 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USE1Q9NZ43 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USE1Q9NZ43 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USE1Q9NZ43 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USE1Q9NZ43 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USE1Q9NZ43 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USE1Q9NZ43 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
USE1Q9NZ43 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USE1Q9NZ43 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USE1Q9NZ43 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USE1Q9NZ43 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USE1Q9NZ43 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USE1Q9NZ43 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USE1Q9NZ43 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
USE1Q9NZ43 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USE1Q9NZ43 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
USE1Q9NZ43 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USE1Q9NZ43 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USE1Q9NZ43 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
USE1Q9NZ43 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USE1Q9NZ43 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USE1Q9NZ43 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USE1Q9NZ43 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USE1Q9NZ43 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USE1Q9NZ43 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
USE1Q9NZ43 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USE1Q9NZ43 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USE1Q9NZ43 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
USE1Q9NZ43 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USE1Q9NZ43 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USE1Q9NZ43 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USE1Q9NZ43 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
USE1Q9NZ43 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USE1Q9NZ43 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USE1Q9NZ43 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USE1Q9NZ43 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USE1Q9NZ43 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USE1Q9NZ43 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USE1Q9NZ43 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USE1Q9NZ43 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USE1Q9NZ43 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USE1Q9NZ43 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USE1Q9NZ43 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USE1Q9NZ43 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
USE1Q9NZ43 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USE1Q9NZ43 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USE1Q9NZ43 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USE1Q9NZ43 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USE1Q9NZ43 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USE1Q9NZ43 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USE1Q9NZ43 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USE1Q9NZ43 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USE1Q9NZ43 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USE1Q9NZ43 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
USE1Q9NZ43 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
USE1Q9NZ43 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
USE1Q9NZ43 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USE1Q9NZ43 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USE1Q9NZ43 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USE1Q9NZ43 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USE1Q9NZ43 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USE1Q9NZ43 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USE1Q9NZ43 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USE1Q9NZ43 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USE1Q9NZ43 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USE1Q9NZ43 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USE1Q9NZ43 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USE1Q9NZ43 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USE1Q9NZ43 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USE1Q9NZ43 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USE1Q9NZ43 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USE1Q9NZ43 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USE1Q9NZ43 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USE1Q9NZ43 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USE1Q9NZ43 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USE1Q9NZ43 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USE1Q9NZ43 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USE1Q9NZ43 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USE1Q9NZ43 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms