Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVK13-1Q9NX77 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVK13-1Q9NX77 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVK13-1Q9NX77 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVK13-1Q9NX77 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVK13-1Q9NX77 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ERVK13-1Q9NX77 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVK13-1Q9NX77 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVK13-1Q9NX77 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVK13-1Q9NX77 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVK13-1Q9NX77 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVK13-1Q9NX77 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVK13-1Q9NX77 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVK13-1Q9NX77 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVK13-1Q9NX77 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVK13-1Q9NX77 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVK13-1Q9NX77 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVK13-1Q9NX77 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVK13-1Q9NX77 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVK13-1Q9NX77 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVK13-1Q9NX77 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVK13-1Q9NX77 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVK13-1Q9NX77 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVK13-1Q9NX77 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVK13-1Q9NX77 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVK13-1Q9NX77 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVK13-1Q9NX77 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ERVK13-1Q9NX77 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVK13-1Q9NX77 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVK13-1Q9NX77 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVK13-1Q9NX77 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVK13-1Q9NX77 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVK13-1Q9NX77 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVK13-1Q9NX77 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVK13-1Q9NX77 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVK13-1Q9NX77 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVK13-1Q9NX77 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVK13-1Q9NX77 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVK13-1Q9NX77 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVK13-1Q9NX77 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVK13-1Q9NX77 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVK13-1Q9NX77 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVK13-1Q9NX77 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVK13-1Q9NX77 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVK13-1Q9NX77 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVK13-1Q9NX77 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVK13-1Q9NX77 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVK13-1Q9NX77 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVK13-1Q9NX77 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVK13-1Q9NX77 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVK13-1Q9NX77 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVK13-1Q9NX77 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVK13-1Q9NX77 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVK13-1Q9NX77 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ERVK13-1Q9NX77 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ERVK13-1Q9NX77 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ERVK13-1Q9NX77 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVK13-1Q9NX77 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVK13-1Q9NX77 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVK13-1Q9NX77 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVK13-1Q9NX77 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVK13-1Q9NX77 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVK13-1Q9NX77 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVK13-1Q9NX77 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVK13-1Q9NX77 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVK13-1Q9NX77 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVK13-1Q9NX77 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVK13-1Q9NX77 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVK13-1Q9NX77 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVK13-1Q9NX77 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVK13-1Q9NX77 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVK13-1Q9NX77 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVK13-1Q9NX77 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVK13-1Q9NX77 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVK13-1Q9NX77 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERVK13-1Q9NX77 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVK13-1Q9NX77 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVK13-1Q9NX77 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVK13-1Q9NX77 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVK13-1Q9NX77 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVK13-1Q9NX77 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVK13-1Q9NX77 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVK13-1Q9NX77 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVK13-1Q9NX77 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVK13-1Q9NX77 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVK13-1Q9NX77 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVK13-1Q9NX77 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVK13-1Q9NX77 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVK13-1Q9NX77 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVK13-1Q9NX77 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVK13-1Q9NX77 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVK13-1Q9NX77 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVK13-1Q9NX77 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVK13-1Q9NX77 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVK13-1Q9NX77 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVK13-1Q9NX77 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVK13-1Q9NX77 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVK13-1Q9NX77 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVK13-1Q9NX77 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVK13-1Q9NX77 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms