Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHBDL2Q9NX52 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RHBDL2Q9NX52 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDL2Q9NX52 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RHBDL2Q9NX52 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDL2Q9NX52 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDL2Q9NX52 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDL2Q9NX52 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDL2Q9NX52 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDL2Q9NX52 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDL2Q9NX52 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDL2Q9NX52 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDL2Q9NX52 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDL2Q9NX52 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RHBDL2Q9NX52 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHBDL2Q9NX52 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHBDL2Q9NX52 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RHBDL2Q9NX52 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHBDL2Q9NX52 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHBDL2Q9NX52 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RHBDL2Q9NX52 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHBDL2Q9NX52 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHBDL2Q9NX52 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHBDL2Q9NX52 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHBDL2Q9NX52 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHBDL2Q9NX52 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHBDL2Q9NX52 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHBDL2Q9NX52 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHBDL2Q9NX52 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHBDL2Q9NX52 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHBDL2Q9NX52 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHBDL2Q9NX52 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHBDL2Q9NX52 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHBDL2Q9NX52 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHBDL2Q9NX52 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHBDL2Q9NX52 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDL2Q9NX52 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDL2Q9NX52 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDL2Q9NX52 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDL2Q9NX52 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDL2Q9NX52 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDL2Q9NX52 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDL2Q9NX52 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDL2Q9NX52 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHBDL2Q9NX52 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHBDL2Q9NX52 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHBDL2Q9NX52 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHBDL2Q9NX52 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDL2Q9NX52 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDL2Q9NX52 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDL2Q9NX52 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHBDL2Q9NX52 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHBDL2Q9NX52 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHBDL2Q9NX52 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHBDL2Q9NX52 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RHBDL2Q9NX52 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHBDL2Q9NX52 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHBDL2Q9NX52 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHBDL2Q9NX52 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHBDL2Q9NX52 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHBDL2Q9NX52 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHBDL2Q9NX52 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDL2Q9NX52 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDL2Q9NX52 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDL2Q9NX52 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDL2Q9NX52 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDL2Q9NX52 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHBDL2Q9NX52 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHBDL2Q9NX52 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHBDL2Q9NX52 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHBDL2Q9NX52 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDL2Q9NX52 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDL2Q9NX52 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDL2Q9NX52 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHBDL2Q9NX52 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHBDL2Q9NX52 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHBDL2Q9NX52 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHBDL2Q9NX52 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDL2Q9NX52 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDL2Q9NX52 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDL2Q9NX52 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDL2Q9NX52 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDL2Q9NX52 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDL2Q9NX52 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDL2Q9NX52 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDL2Q9NX52 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHBDL2Q9NX52 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RHBDL2Q9NX52 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHBDL2Q9NX52 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHBDL2Q9NX52 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHBDL2Q9NX52 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHBDL2Q9NX52 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHBDL2Q9NX52 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHBDL2Q9NX52 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHBDL2Q9NX52 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHBDL2Q9NX52 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHBDL2Q9NX52 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHBDL2Q9NX52 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDL2Q9NX52 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHBDL2Q9NX52 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.2 ms