Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW0

HCFC1R1, Host cell factor C1 regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCFC1R1Q9NWW0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HCFC1R1Q9NWW0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HCFC1R1Q9NWW0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HCFC1R1Q9NWW0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HCFC1R1Q9NWW0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HCFC1R1Q9NWW0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HCFC1R1Q9NWW0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HCFC1R1Q9NWW0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HCFC1R1Q9NWW0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HCFC1R1Q9NWW0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HCFC1R1Q9NWW0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HCFC1R1Q9NWW0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HCFC1R1Q9NWW0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HCFC1R1Q9NWW0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HCFC1R1Q9NWW0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HCFC1R1Q9NWW0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HCFC1R1Q9NWW0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HCFC1R1Q9NWW0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HCFC1R1Q9NWW0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HCFC1R1Q9NWW0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HCFC1R1Q9NWW0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HCFC1R1Q9NWW0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HCFC1R1Q9NWW0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HCFC1R1Q9NWW0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HCFC1R1Q9NWW0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HCFC1R1Q9NWW0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HCFC1R1Q9NWW0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HCFC1R1Q9NWW0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HCFC1R1Q9NWW0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HCFC1R1Q9NWW0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
HCFC1R1Q9NWW0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HCFC1R1Q9NWW0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HCFC1R1Q9NWW0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HCFC1R1Q9NWW0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HCFC1R1Q9NWW0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HCFC1R1Q9NWW0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HCFC1R1Q9NWW0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HCFC1R1Q9NWW0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
HCFC1R1Q9NWW0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HCFC1R1Q9NWW0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
HCFC1R1Q9NWW0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HCFC1R1Q9NWW0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HCFC1R1Q9NWW0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HCFC1R1Q9NWW0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HCFC1R1Q9NWW0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HCFC1R1Q9NWW0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HCFC1R1Q9NWW0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HCFC1R1Q9NWW0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HCFC1R1Q9NWW0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HCFC1R1Q9NWW0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HCFC1R1Q9NWW0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HCFC1R1Q9NWW0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HCFC1R1Q9NWW0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HCFC1R1Q9NWW0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HCFC1R1Q9NWW0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
HCFC1R1Q9NWW0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
HCFC1R1Q9NWW0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HCFC1R1Q9NWW0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HCFC1R1Q9NWW0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HCFC1R1Q9NWW0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HCFC1R1Q9NWW0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HCFC1R1Q9NWW0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HCFC1R1Q9NWW0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HCFC1R1Q9NWW0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HCFC1R1Q9NWW0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HCFC1R1Q9NWW0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HCFC1R1Q9NWW0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HCFC1R1Q9NWW0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HCFC1R1Q9NWW0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HCFC1R1Q9NWW0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
HCFC1R1Q9NWW0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HCFC1R1Q9NWW0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HCFC1R1Q9NWW0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HCFC1R1Q9NWW0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
HCFC1R1Q9NWW0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HCFC1R1Q9NWW0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HCFC1R1Q9NWW0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HCFC1R1Q9NWW0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HCFC1R1Q9NWW0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HCFC1R1Q9NWW0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HCFC1R1Q9NWW0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HCFC1R1Q9NWW0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HCFC1R1Q9NWW0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HCFC1R1Q9NWW0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HCFC1R1Q9NWW0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
HCFC1R1Q9NWW0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HCFC1R1Q9NWW0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HCFC1R1Q9NWW0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HCFC1R1Q9NWW0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HCFC1R1Q9NWW0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HCFC1R1Q9NWW0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HCFC1R1Q9NWW0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HCFC1R1Q9NWW0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HCFC1R1Q9NWW0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HCFC1R1Q9NWW0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HCFC1R1Q9NWW0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
HCFC1R1Q9NWW0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HCFC1R1Q9NWW0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HCFC1R1Q9NWW0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HCFC1R1Q9NWW0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms