Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM30AQ9NV96 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM30AQ9NV96 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TMEM30AQ9NV96 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMEM30AQ9NV96 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMEM30AQ9NV96 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM30AQ9NV96 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM30AQ9NV96 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM30AQ9NV96 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM30AQ9NV96 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM30AQ9NV96 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM30AQ9NV96 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM30AQ9NV96 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM30AQ9NV96 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM30AQ9NV96 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM30AQ9NV96 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM30AQ9NV96 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM30AQ9NV96 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM30AQ9NV96 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM30AQ9NV96 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM30AQ9NV96 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM30AQ9NV96 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM30AQ9NV96 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM30AQ9NV96 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM30AQ9NV96 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM30AQ9NV96 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM30AQ9NV96 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM30AQ9NV96 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM30AQ9NV96 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM30AQ9NV96 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM30AQ9NV96 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM30AQ9NV96 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TMEM30AQ9NV96 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TMEM30AQ9NV96 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TMEM30AQ9NV96 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM30AQ9NV96 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM30AQ9NV96 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM30AQ9NV96 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM30AQ9NV96 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM30AQ9NV96 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM30AQ9NV96 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM30AQ9NV96 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM30AQ9NV96 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM30AQ9NV96 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM30AQ9NV96 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM30AQ9NV96 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM30AQ9NV96 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM30AQ9NV96 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM30AQ9NV96 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM30AQ9NV96 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM30AQ9NV96 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM30AQ9NV96 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM30AQ9NV96 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM30AQ9NV96 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM30AQ9NV96 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM30AQ9NV96 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM30AQ9NV96 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM30AQ9NV96 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM30AQ9NV96 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM30AQ9NV96 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM30AQ9NV96 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM30AQ9NV96 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM30AQ9NV96 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM30AQ9NV96 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM30AQ9NV96 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM30AQ9NV96 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM30AQ9NV96 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM30AQ9NV96 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM30AQ9NV96 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM30AQ9NV96 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM30AQ9NV96 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM30AQ9NV96 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM30AQ9NV96 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM30AQ9NV96 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM30AQ9NV96 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM30AQ9NV96 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM30AQ9NV96 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM30AQ9NV96 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM30AQ9NV96 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM30AQ9NV96 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM30AQ9NV96 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM30AQ9NV96 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM30AQ9NV96 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM30AQ9NV96 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM30AQ9NV96 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM30AQ9NV96 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM30AQ9NV96 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM30AQ9NV96 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM30AQ9NV96 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM30AQ9NV96 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM30AQ9NV96 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM30AQ9NV96 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM30AQ9NV96 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM30AQ9NV96 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM30AQ9NV96 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM30AQ9NV96 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TMEM30AQ9NV96 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM30AQ9NV96 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMEM30AQ9NV96 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TMEM30AQ9NV96 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms