Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKDREJQ9NTG1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKDREJQ9NTG1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKDREJQ9NTG1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKDREJQ9NTG1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKDREJQ9NTG1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PKDREJQ9NTG1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PKDREJQ9NTG1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PKDREJQ9NTG1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKDREJQ9NTG1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKDREJQ9NTG1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PKDREJQ9NTG1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKDREJQ9NTG1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKDREJQ9NTG1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PKDREJQ9NTG1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PKDREJQ9NTG1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKDREJQ9NTG1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKDREJQ9NTG1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PKDREJQ9NTG1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKDREJQ9NTG1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKDREJQ9NTG1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PKDREJQ9NTG1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKDREJQ9NTG1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKDREJQ9NTG1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKDREJQ9NTG1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PKDREJQ9NTG1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKDREJQ9NTG1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKDREJQ9NTG1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PKDREJQ9NTG1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKDREJQ9NTG1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKDREJQ9NTG1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKDREJQ9NTG1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKDREJQ9NTG1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKDREJQ9NTG1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKDREJQ9NTG1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PKDREJQ9NTG1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKDREJQ9NTG1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKDREJQ9NTG1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PKDREJQ9NTG1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PKDREJQ9NTG1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKDREJQ9NTG1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PKDREJQ9NTG1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKDREJQ9NTG1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKDREJQ9NTG1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKDREJQ9NTG1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKDREJQ9NTG1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKDREJQ9NTG1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PKDREJQ9NTG1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PKDREJQ9NTG1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PKDREJQ9NTG1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKDREJQ9NTG1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKDREJQ9NTG1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKDREJQ9NTG1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKDREJQ9NTG1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKDREJQ9NTG1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKDREJQ9NTG1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PKDREJQ9NTG1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKDREJQ9NTG1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKDREJQ9NTG1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKDREJQ9NTG1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PKDREJQ9NTG1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKDREJQ9NTG1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKDREJQ9NTG1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKDREJQ9NTG1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKDREJQ9NTG1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PKDREJQ9NTG1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKDREJQ9NTG1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PKDREJQ9NTG1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKDREJQ9NTG1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKDREJQ9NTG1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PKDREJQ9NTG1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKDREJQ9NTG1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKDREJQ9NTG1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKDREJQ9NTG1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKDREJQ9NTG1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKDREJQ9NTG1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PKDREJQ9NTG1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKDREJQ9NTG1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKDREJQ9NTG1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKDREJQ9NTG1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKDREJQ9NTG1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKDREJQ9NTG1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PKDREJQ9NTG1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PKDREJQ9NTG1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKDREJQ9NTG1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKDREJQ9NTG1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKDREJQ9NTG1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PKDREJQ9NTG1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKDREJQ9NTG1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKDREJQ9NTG1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKDREJQ9NTG1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKDREJQ9NTG1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PKDREJQ9NTG1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKDREJQ9NTG1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKDREJQ9NTG1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKDREJQ9NTG1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PKDREJQ9NTG1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PKDREJQ9NTG1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKDREJQ9NTG1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKDREJQ9NTG1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms