Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
RRP7BPQ9NSQ0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC38.54■■■■□ 3.76
RRP7BPQ9NSQ0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
RRP7BPQ9NSQ0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
RRP7BPQ9NSQ0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC38.53■■■■□ 3.76
RRP7BPQ9NSQ0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
RRP7BPQ9NSQ0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
RRP7BPQ9NSQ0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
RRP7BPQ9NSQ0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
RRP7BPQ9NSQ0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
RRP7BPQ9NSQ0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
RRP7BPQ9NSQ0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
RRP7BPQ9NSQ0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
RRP7BPQ9NSQ0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
RRP7BPQ9NSQ0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
RRP7BPQ9NSQ0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC38.49■■■■□ 3.75
RRP7BPQ9NSQ0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
RRP7BPQ9NSQ0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
RRP7BPQ9NSQ0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
RRP7BPQ9NSQ0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
RRP7BPQ9NSQ0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
RRP7BPQ9NSQ0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC38.48■■■■□ 3.75
RRP7BPQ9NSQ0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.47■■■■□ 3.75
RRP7BPQ9NSQ0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
RRP7BPQ9NSQ0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
RRP7BPQ9NSQ0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
RRP7BPQ9NSQ0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
RRP7BPQ9NSQ0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
RRP7BPQ9NSQ0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
RRP7BPQ9NSQ0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
RRP7BPQ9NSQ0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
RRP7BPQ9NSQ0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
RRP7BPQ9NSQ0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
RRP7BPQ9NSQ0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
RRP7BPQ9NSQ0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
RRP7BPQ9NSQ0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
RRP7BPQ9NSQ0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
RRP7BPQ9NSQ0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
RRP7BPQ9NSQ0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
RRP7BPQ9NSQ0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
RRP7BPQ9NSQ0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
RRP7BPQ9NSQ0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
RRP7BPQ9NSQ0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
RRP7BPQ9NSQ0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
RRP7BPQ9NSQ0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
RRP7BPQ9NSQ0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
RRP7BPQ9NSQ0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
RRP7BPQ9NSQ0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
RRP7BPQ9NSQ0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
RRP7BPQ9NSQ0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
RRP7BPQ9NSQ0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
RRP7BPQ9NSQ0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
RRP7BPQ9NSQ0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
RRP7BPQ9NSQ0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
RRP7BPQ9NSQ0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
RRP7BPQ9NSQ0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
RRP7BPQ9NSQ0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC38.33■■■■□ 3.73
RRP7BPQ9NSQ0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
RRP7BPQ9NSQ0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
RRP7BPQ9NSQ0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
RRP7BPQ9NSQ0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
RRP7BPQ9NSQ0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
RRP7BPQ9NSQ0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
RRP7BPQ9NSQ0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.72
RRP7BPQ9NSQ0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
RRP7BPQ9NSQ0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
RRP7BPQ9NSQ0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
RRP7BPQ9NSQ0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
RRP7BPQ9NSQ0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
RRP7BPQ9NSQ0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
RRP7BPQ9NSQ0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
RRP7BPQ9NSQ0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC38.29■■■■□ 3.72
RRP7BPQ9NSQ0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
RRP7BPQ9NSQ0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
RRP7BPQ9NSQ0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
RRP7BPQ9NSQ0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
RRP7BPQ9NSQ0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
RRP7BPQ9NSQ0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
RRP7BPQ9NSQ0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
RRP7BPQ9NSQ0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
RRP7BPQ9NSQ0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
RRP7BPQ9NSQ0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
RRP7BPQ9NSQ0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC38.23■■■■□ 3.71
RRP7BPQ9NSQ0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
RRP7BPQ9NSQ0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
RRP7BPQ9NSQ0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
RRP7BPQ9NSQ0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
RRP7BPQ9NSQ0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
RRP7BPQ9NSQ0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
RRP7BPQ9NSQ0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
RRP7BPQ9NSQ0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC38.2■■■■□ 3.71
RRP7BPQ9NSQ0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC38.2■■■■□ 3.71
RRP7BPQ9NSQ0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
RRP7BPQ9NSQ0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
RRP7BPQ9NSQ0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
RRP7BPQ9NSQ0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
RRP7BPQ9NSQ0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
RRP7BPQ9NSQ0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms