Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
SALL1Q9NSC2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.56
SALL1Q9NSC2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
SALL1Q9NSC2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
SALL1Q9NSC2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SALL1Q9NSC2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SALL1Q9NSC2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
SALL1Q9NSC2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC31■■■□□ 2.55
SALL1Q9NSC2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SALL1Q9NSC2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SALL1Q9NSC2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SALL1Q9NSC2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SALL1Q9NSC2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SALL1Q9NSC2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SALL1Q9NSC2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SALL1Q9NSC2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SALL1Q9NSC2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SALL1Q9NSC2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SALL1Q9NSC2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SALL1Q9NSC2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SALL1Q9NSC2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SALL1Q9NSC2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SALL1Q9NSC2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
SALL1Q9NSC2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SALL1Q9NSC2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
SALL1Q9NSC2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
SALL1Q9NSC2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
SALL1Q9NSC2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SALL1Q9NSC2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SALL1Q9NSC2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SALL1Q9NSC2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
SALL1Q9NSC2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
SALL1Q9NSC2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
SALL1Q9NSC2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.54
SALL1Q9NSC2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
SALL1Q9NSC2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
SALL1Q9NSC2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SALL1Q9NSC2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SALL1Q9NSC2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
SALL1Q9NSC2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SALL1Q9NSC2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SALL1Q9NSC2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SALL1Q9NSC2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SALL1Q9NSC2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SALL1Q9NSC2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SALL1Q9NSC2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SALL1Q9NSC2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SALL1Q9NSC2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SALL1Q9NSC2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SALL1Q9NSC2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SALL1Q9NSC2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SALL1Q9NSC2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SALL1Q9NSC2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SALL1Q9NSC2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SALL1Q9NSC2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SALL1Q9NSC2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SALL1Q9NSC2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SALL1Q9NSC2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SALL1Q9NSC2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SALL1Q9NSC2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SALL1Q9NSC2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SALL1Q9NSC2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SALL1Q9NSC2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SALL1Q9NSC2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
SALL1Q9NSC2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SALL1Q9NSC2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SALL1Q9NSC2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SALL1Q9NSC2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SALL1Q9NSC2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SALL1Q9NSC2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SALL1Q9NSC2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SALL1Q9NSC2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SALL1Q9NSC2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SALL1Q9NSC2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SALL1Q9NSC2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SALL1Q9NSC2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
SALL1Q9NSC2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SALL1Q9NSC2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SALL1Q9NSC2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SALL1Q9NSC2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SALL1Q9NSC2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SALL1Q9NSC2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SALL1Q9NSC2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SALL1Q9NSC2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SALL1Q9NSC2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SALL1Q9NSC2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
SALL1Q9NSC2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SALL1Q9NSC2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SALL1Q9NSC2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SALL1Q9NSC2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SALL1Q9NSC2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SALL1Q9NSC2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
SALL1Q9NSC2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
SALL1Q9NSC2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SALL1Q9NSC2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SALL1Q9NSC2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SALL1Q9NSC2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SALL1Q9NSC2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SALL1Q9NSC2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SALL1Q9NSC2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms