Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TOPORSQ9NS56 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOPORSQ9NS56 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOPORSQ9NS56 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOPORSQ9NS56 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TOPORSQ9NS56 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TOPORSQ9NS56 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TOPORSQ9NS56 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TOPORSQ9NS56 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TOPORSQ9NS56 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TOPORSQ9NS56 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TOPORSQ9NS56 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TOPORSQ9NS56 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TOPORSQ9NS56 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TOPORSQ9NS56 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TOPORSQ9NS56 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TOPORSQ9NS56 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TOPORSQ9NS56 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TOPORSQ9NS56 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TOPORSQ9NS56 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TOPORSQ9NS56 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TOPORSQ9NS56 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TOPORSQ9NS56 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TOPORSQ9NS56 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TOPORSQ9NS56 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TOPORSQ9NS56 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TOPORSQ9NS56 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TOPORSQ9NS56 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TOPORSQ9NS56 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TOPORSQ9NS56 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOPORSQ9NS56 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOPORSQ9NS56 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOPORSQ9NS56 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOPORSQ9NS56 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TOPORSQ9NS56 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TOPORSQ9NS56 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TOPORSQ9NS56 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TOPORSQ9NS56 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TOPORSQ9NS56 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOPORSQ9NS56 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOPORSQ9NS56 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOPORSQ9NS56 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOPORSQ9NS56 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOPORSQ9NS56 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TOPORSQ9NS56 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TOPORSQ9NS56 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TOPORSQ9NS56 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TOPORSQ9NS56 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TOPORSQ9NS56 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TOPORSQ9NS56 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TOPORSQ9NS56 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TOPORSQ9NS56 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TOPORSQ9NS56 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TOPORSQ9NS56 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TOPORSQ9NS56 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TOPORSQ9NS56 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TOPORSQ9NS56 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TOPORSQ9NS56 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TOPORSQ9NS56 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TOPORSQ9NS56 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TOPORSQ9NS56 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TOPORSQ9NS56 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TOPORSQ9NS56 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TOPORSQ9NS56 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TOPORSQ9NS56 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TOPORSQ9NS56 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TOPORSQ9NS56 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TOPORSQ9NS56 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TOPORSQ9NS56 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TOPORSQ9NS56 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TOPORSQ9NS56 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TOPORSQ9NS56 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TOPORSQ9NS56 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TOPORSQ9NS56 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TOPORSQ9NS56 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOPORSQ9NS56 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOPORSQ9NS56 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOPORSQ9NS56 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOPORSQ9NS56 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOPORSQ9NS56 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOPORSQ9NS56 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOPORSQ9NS56 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOPORSQ9NS56 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOPORSQ9NS56 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOPORSQ9NS56 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOPORSQ9NS56 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TOPORSQ9NS56 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOPORSQ9NS56 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOPORSQ9NS56 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOPORSQ9NS56 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TOPORSQ9NS56 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOPORSQ9NS56 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOPORSQ9NS56 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOPORSQ9NS56 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOPORSQ9NS56 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOPORSQ9NS56 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOPORSQ9NS56 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOPORSQ9NS56 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TOPORSQ9NS56 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TOPORSQ9NS56 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms