Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VPS45Q9NRW7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VPS45Q9NRW7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
VPS45Q9NRW7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VPS45Q9NRW7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VPS45Q9NRW7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VPS45Q9NRW7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VPS45Q9NRW7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VPS45Q9NRW7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VPS45Q9NRW7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
VPS45Q9NRW7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VPS45Q9NRW7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VPS45Q9NRW7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VPS45Q9NRW7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VPS45Q9NRW7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VPS45Q9NRW7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VPS45Q9NRW7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VPS45Q9NRW7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VPS45Q9NRW7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VPS45Q9NRW7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VPS45Q9NRW7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VPS45Q9NRW7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VPS45Q9NRW7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VPS45Q9NRW7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VPS45Q9NRW7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VPS45Q9NRW7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VPS45Q9NRW7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VPS45Q9NRW7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VPS45Q9NRW7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VPS45Q9NRW7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VPS45Q9NRW7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VPS45Q9NRW7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VPS45Q9NRW7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VPS45Q9NRW7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
VPS45Q9NRW7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
VPS45Q9NRW7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VPS45Q9NRW7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VPS45Q9NRW7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VPS45Q9NRW7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VPS45Q9NRW7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VPS45Q9NRW7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS45Q9NRW7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS45Q9NRW7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS45Q9NRW7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS45Q9NRW7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS45Q9NRW7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VPS45Q9NRW7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VPS45Q9NRW7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VPS45Q9NRW7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VPS45Q9NRW7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VPS45Q9NRW7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VPS45Q9NRW7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VPS45Q9NRW7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS45Q9NRW7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS45Q9NRW7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS45Q9NRW7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VPS45Q9NRW7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
VPS45Q9NRW7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS45Q9NRW7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS45Q9NRW7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS45Q9NRW7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VPS45Q9NRW7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VPS45Q9NRW7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VPS45Q9NRW7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VPS45Q9NRW7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VPS45Q9NRW7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VPS45Q9NRW7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VPS45Q9NRW7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS45Q9NRW7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS45Q9NRW7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS45Q9NRW7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VPS45Q9NRW7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS45Q9NRW7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS45Q9NRW7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS45Q9NRW7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS45Q9NRW7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS45Q9NRW7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS45Q9NRW7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VPS45Q9NRW7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS45Q9NRW7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
VPS45Q9NRW7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS45Q9NRW7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS45Q9NRW7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS45Q9NRW7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS45Q9NRW7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VPS45Q9NRW7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS45Q9NRW7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
VPS45Q9NRW7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
VPS45Q9NRW7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VPS45Q9NRW7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
VPS45Q9NRW7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS45Q9NRW7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS45Q9NRW7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS45Q9NRW7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS45Q9NRW7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS45Q9NRW7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS45Q9NRW7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS45Q9NRW7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS45Q9NRW7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VPS45Q9NRW7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms