Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDHAF3Q9NRP4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDHAF3Q9NRP4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDHAF3Q9NRP4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDHAF3Q9NRP4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDHAF3Q9NRP4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDHAF3Q9NRP4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDHAF3Q9NRP4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDHAF3Q9NRP4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDHAF3Q9NRP4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SDHAF3Q9NRP4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SDHAF3Q9NRP4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDHAF3Q9NRP4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDHAF3Q9NRP4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDHAF3Q9NRP4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDHAF3Q9NRP4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDHAF3Q9NRP4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SDHAF3Q9NRP4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SDHAF3Q9NRP4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDHAF3Q9NRP4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDHAF3Q9NRP4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDHAF3Q9NRP4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDHAF3Q9NRP4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDHAF3Q9NRP4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDHAF3Q9NRP4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SDHAF3Q9NRP4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SDHAF3Q9NRP4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SDHAF3Q9NRP4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SDHAF3Q9NRP4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDHAF3Q9NRP4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SDHAF3Q9NRP4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDHAF3Q9NRP4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDHAF3Q9NRP4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDHAF3Q9NRP4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDHAF3Q9NRP4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SDHAF3Q9NRP4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SDHAF3Q9NRP4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDHAF3Q9NRP4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDHAF3Q9NRP4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDHAF3Q9NRP4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SDHAF3Q9NRP4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDHAF3Q9NRP4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDHAF3Q9NRP4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDHAF3Q9NRP4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDHAF3Q9NRP4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDHAF3Q9NRP4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SDHAF3Q9NRP4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDHAF3Q9NRP4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SDHAF3Q9NRP4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SDHAF3Q9NRP4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDHAF3Q9NRP4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SDHAF3Q9NRP4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDHAF3Q9NRP4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDHAF3Q9NRP4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDHAF3Q9NRP4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SDHAF3Q9NRP4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SDHAF3Q9NRP4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SDHAF3Q9NRP4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDHAF3Q9NRP4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDHAF3Q9NRP4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDHAF3Q9NRP4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDHAF3Q9NRP4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDHAF3Q9NRP4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SDHAF3Q9NRP4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDHAF3Q9NRP4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDHAF3Q9NRP4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SDHAF3Q9NRP4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SDHAF3Q9NRP4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDHAF3Q9NRP4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SDHAF3Q9NRP4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDHAF3Q9NRP4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDHAF3Q9NRP4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDHAF3Q9NRP4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SDHAF3Q9NRP4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SDHAF3Q9NRP4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDHAF3Q9NRP4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDHAF3Q9NRP4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDHAF3Q9NRP4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SDHAF3Q9NRP4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDHAF3Q9NRP4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SDHAF3Q9NRP4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDHAF3Q9NRP4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDHAF3Q9NRP4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDHAF3Q9NRP4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SDHAF3Q9NRP4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDHAF3Q9NRP4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDHAF3Q9NRP4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDHAF3Q9NRP4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SDHAF3Q9NRP4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SDHAF3Q9NRP4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDHAF3Q9NRP4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDHAF3Q9NRP4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SDHAF3Q9NRP4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDHAF3Q9NRP4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDHAF3Q9NRP4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDHAF3Q9NRP4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDHAF3Q9NRP4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDHAF3Q9NRP4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SDHAF3Q9NRP4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SDHAF3Q9NRP4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms