Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD0

FBXO8, F-box only protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO8Q9NRD0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO8Q9NRD0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO8Q9NRD0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO8Q9NRD0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO8Q9NRD0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO8Q9NRD0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO8Q9NRD0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO8Q9NRD0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO8Q9NRD0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO8Q9NRD0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO8Q9NRD0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO8Q9NRD0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO8Q9NRD0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO8Q9NRD0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO8Q9NRD0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO8Q9NRD0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO8Q9NRD0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO8Q9NRD0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO8Q9NRD0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO8Q9NRD0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO8Q9NRD0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO8Q9NRD0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO8Q9NRD0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO8Q9NRD0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO8Q9NRD0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO8Q9NRD0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO8Q9NRD0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO8Q9NRD0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO8Q9NRD0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO8Q9NRD0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FBXO8Q9NRD0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FBXO8Q9NRD0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FBXO8Q9NRD0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO8Q9NRD0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO8Q9NRD0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO8Q9NRD0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO8Q9NRD0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO8Q9NRD0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO8Q9NRD0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO8Q9NRD0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO8Q9NRD0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
FBXO8Q9NRD0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO8Q9NRD0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO8Q9NRD0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO8Q9NRD0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO8Q9NRD0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FBXO8Q9NRD0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO8Q9NRD0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO8Q9NRD0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FBXO8Q9NRD0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO8Q9NRD0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO8Q9NRD0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO8Q9NRD0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FBXO8Q9NRD0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO8Q9NRD0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO8Q9NRD0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO8Q9NRD0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO8Q9NRD0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FBXO8Q9NRD0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO8Q9NRD0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO8Q9NRD0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO8Q9NRD0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO8Q9NRD0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO8Q9NRD0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FBXO8Q9NRD0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FBXO8Q9NRD0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FBXO8Q9NRD0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXO8Q9NRD0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXO8Q9NRD0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXO8Q9NRD0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FBXO8Q9NRD0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXO8Q9NRD0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXO8Q9NRD0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXO8Q9NRD0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FBXO8Q9NRD0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO8Q9NRD0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO8Q9NRD0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO8Q9NRD0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FBXO8Q9NRD0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXO8Q9NRD0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXO8Q9NRD0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXO8Q9NRD0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXO8Q9NRD0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXO8Q9NRD0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FBXO8Q9NRD0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXO8Q9NRD0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXO8Q9NRD0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXO8Q9NRD0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXO8Q9NRD0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXO8Q9NRD0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FBXO8Q9NRD0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXO8Q9NRD0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FBXO8Q9NRD0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXO8Q9NRD0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXO8Q9NRD0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXO8Q9NRD0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FBXO8Q9NRD0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FBXO8Q9NRD0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FBXO8Q9NRD0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FBXO8Q9NRD0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms